多是在地底下、巖洞中，需要有豐富的地下水來源，地下水又多含有飽和的二氧化硅，同時此中的壓力約需在大氣壓力下的二倍至三倍左右，溫度則需在550-600℃間，再給予適當時間，水晶就會依著「三方晶系」(hexagonal system)的自然法則，而結晶成六方柱狀的水晶了。通常，在人為控制的理想環境中，即是物理、化學條件都符合上述條件的狀況下，水晶的生長速度約為每天0.8毫米(mm)。這也是許多人造水晶的實驗室、工廠的標準生產速度。由此所培養出來的
水晶，就是所謂的「人造水晶」(synthetic quartz)，通常多切割為晶片(chips)供作電子、電腦、通訊工業用途;也有人稱為「養晶」(cultivated quartz, cultured quatrtz)，雖是使用不同的名詞，其實講的是相同的東西。一般，工業用途的人造水晶，其厚度約需三釐米左右，即30mm，需要約40 天左右的時間來成長;若要供作珠寶業來磨成十釐米(100mm)以上的水晶球，通常約需120～180 天也就夠了。但是，這都是在人為控制下最理想的環境中，才有可能有這種速度，在自然界中，情形就沒有這麼樂觀，因為原料、水質、溫度、壓力等等的條件一直在變化當中，很難得達到理想狀況，通常都需要數萬倍、或是數百萬倍的時間，才能達到相同的成長。 這也是為甚麼「地質年齡」動則以「百萬年」為計算基數，也是「天然水晶」(natural crystal)之所以珍貴之處。正常的水晶在生長時，多可以發現和柱形尖端稜線平行的生長紋(growth lines)。由於在地底、巖洞中的生長空間多狹窄，尤其在遇到地震時，或地殼變動時，甚至容易遭到其他礦石的擠壓，常常會壓迫產生不同的「晶面」。還有，當水晶還是在液態狀的時候，常常也會包覆著其他的礦石、泥灰一起結晶成長，如金紅石(稍後變成發晶)、火山泥灰(稍後變成幻影水晶)等等。所有的這些，都是「自然的一部分」，請不要視為「瑕疵」。
