得注意的是，山藥中的澱粉含量較高，胸腹脹滿、大便乾燥、便秘者最好少吃。山藥是偏補的藥，甘平且偏熱，體質偏熱、容易上火的人也要慎食。有些人愛用山藥涮火鍋，若再配上麻辣小料，那更是熱上加熱，也最好少吃。
糖尿病者不可一次吃過量的山藥，食用量較大時應適當減少主食的量。如上所述，山藥能滋陰、補腎、降血糖，能治療糖尿病，六味地黃湯裡面也有山藥。但這裡有一個量的問題。如六味地黃湯中山藥量是有限的，也就是幾錢而已，而糖尿病患者如果要把山藥當食品吃，就會對血糖產生一定影響。山藥屬根莖類食物，澱粉量較高，過食可致血糖升高。
此外，消化性潰瘍和肝硬化患者，應選用蒸、燉等烹飪方法，忌爆炒和醋熘。胃腸道不好的人吃山藥時，不要同時服用小蘇打片等鹼性藥物，以免小蘇打使山藥中的澱粉酶失效。山藥中的薯蕷皂苷可以合成荷爾蒙，如睪丸激素和雌激素，因此，男性前列腺癌患者、女性乳腺癌患者都不宜食用。
