1、病因不同
生殖器皰疹是由單純皰疹病毒侵犯生殖器部位皮膚和黏膜引起的炎症性、複發性的性傳播疾病，可分為1型和2型，1型主要由口唇病灶獲得，2型可從生殖器病灶分離到。
性病性淋巴肉芽腫又名第四性病，是第一代性病之一，最近其病原體被認為是沙眼衣原體，主要通過性接觸傳播。
2、症狀表現有差別
原發感染生殖器皰疹患者生殖器部位可出現多數粟粒大丘疹、水皰，可彼此融合成片，2～4天后破潰成為糜爛或潰瘍，自覺灼癢、疼痛。發病1周內不時有新皮疹出現，7～10天時達高峰，之後逐漸消退結痂，一般需18～21天皮損完全消退，潛伏期3～14天。
性病性淋巴肉芽腫潛伏期7～10日，早期表現為生殖器水皰、糜爛、潰瘍，1～4周後可見腹股溝淋巴結腫大，男性有“槽溝徵”，多數瘻管似“噴水壺狀”，愈後有瘢痕。女性可發生直腸周圍炎，晚期出現象皮腫及直腸狹窄。患者可有寒戰、高熱及關節痛等全身症狀。
3、輔助檢查協助診斷
病理檢查、組織培養、細胞學檢查等可協助診斷。
