有些人因為懼怕手術，因而一拖再拖，甚至長達數十年，結果導致很多併發症發生，從臨床觀察，帶瘻生存最常見的併發症有如下幾種。
1、肛門直腸狹窄：肛瘻病變常侵犯肛門、肛管、直腸壁末端，使結締組織增生，形成環形或半環形瘢痕，由於常年的反覆炎症刺激導致瘢痕攣縮，使肛門、肛管、直腸腔道狹窄，以至大便發生變細、變扁，大便困難，甚至發生腹脹、噁心、嘔吐等腸梗阻症狀，臨床檢查時，發現肛管或者直腸有明顯的瘢痕，肛門緊縮，甚至食指難以通過，個別病人在直腸末端出現瘢痕隆起，類似於直腸癌的體徵，很容易誤診。有些人沒有經過檢查自認為是習慣性便秘，並經大量中西藥治療療效不明顯；還有些人誤認為是得了腸道腫瘤而驚恐萬分，實際上經臨床排查是因為瘻管慢性炎症所致。
2、肛門不完全性失禁：由於肛瘻反覆發作，導致肛管直腸周圍肌肉和軟組織廣泛感染，大量結締組織的增生、變硬，使肛門周圍失去彈性，從而影響肛門的關閉功能，有時對稀便難以控制，造成了不完全性肛門失禁。
3、肛門慢性溼疹：由於肛瘻反覆發作，瘻管常有分泌物溢出，長期刺激肛周皮膚，導致肛周皮膚慢性溼疹，皮膚營養不良，彈性褪變，往往形成肛周廣泛的皸裂樣改變，患者奇癢難忍。
4、肛瘻癌變：經臨床觀察與國內外文獻報道，肛瘻超過十年以上容易發生癌變，一般認為與肛瘻的長期慢性炎症刺激有關。可能由於局部區域淋巴結構被破壞，導致細胞免疫監控能力降低，使瘻管組織逐漸癌變，這些病人主要表現在肛瘻外口排出黏膠狀分泌物，切開瘻管後瘢痕組織脆硬易出血，當然，最後需經過病理組織才能證實。資料顯示，如果肛瘻來源於肛腺，則多為腺癌。
因此，對於肛瘻應有足夠清醒的認識，不能抱有幻想，因為肛瘻只有手術才是根治的辦法，越早治療損傷越小，時間越久，弊病越多，更容易出現併發症。
