腱鞘囊腫一般可以自行消退，不需用藥物治療，但是時間較長。如果想要加快消退時間，可以選醋酸氫化可的松或強的松做囊內注射消除囊腫。病情嚴重的患者可以手術治療，手術治療效果最好，且術後不易復發。
以下腱鞘囊腫手術療法和非手術療法介紹：
1.非手術療法 原理是使囊內容物排出後，在囊內注入藥物或留置可取出的無菌異物如縫扎粗絲線，並加壓包紮，使囊腔粘連而消失。通常是在囊內注入醋酸強的松龍0.5ml，然後加壓包紮。本方法簡單、痛苦較少，複發率也較低。
2. 手術治療 手指腱鞘囊腫一般較小，穿刺困難。可用手指擠壓使其破裂吸收;或用粗針頭抽液後囊內注入透明質酸酶或醋酸氫化考的松類藥物，然後加壓包紮;其他部位多次復發的腱鞘囊腫，都可手術切除。術中應完整切除囊腫，如系腱鞘發生者，邊同時切除部分相連的腱鞘;如系關節囊滑膜疝出，應在根部結紮切除，以減少復發機會。
