平衡針灸學的作用原理，主要是通過針刺神經幹或神經支，給予患者一種適當的良性刺激信號，這種刺激信號既不針對病原體，也不直接針刺病變部位的組織器官，而是把醫生的指令性信息通過針刺神經直接輸給信息高速公路，以最快速度、最佳路線輸送到高級中樞系統。這種來自人為的超強刺激信號，迅速傳遞於大腦中樞調控系統，大腦中樞調控指揮中心積極接收了醫生給予的指令性信息，迅速對高級中樞指揮系統進行應激性調整，調動體內貯存的中樞遞質，再通過神經指揮系統對失調與病變部位的子系統進行對症性調控，釋放大量的能量物質，提高機體免疫功能，提高機體的鎮痛效應，增強機體消炎和代謝作用等。對原來失調的病理狀態和物質代謝紊亂過程，進行間接干預，通過自我修復達到一個新的平衡狀態。這種平衡狀態的形成是利用針灸外因刺激手段激發調動患者機體的平衡調控系統的功能來實現的。
平衡針灸學取穴原則
傳統針灸以循經取穴、辨證取穴為基本原則。平衡針灸主要採用定位取穴、交叉取穴、對應取穴為基本原則。臨床中也配合男左女右取穴、左右交叉取穴、雙側同時取穴等取穴原則。
定位取穴原則
定位取穴原則主要是指針對某一病變的部位來選取特定穴位。如腰痛穴(BP-HN)、升提穴(BP-HN)、精裂穴(BP-LE8)、痛經穴(BP-A)等。也就是說通過針刺特定部位的特定穴位達到治療另一部位疾病，同時又不能用交叉、對應來解釋的取穴原則。
交叉取穴原則
交叉取穴的原則主要是指左右上下交叉取穴。如臀痛穴(BP-UE)、升提穴(BP-HN)、膝痛穴(BP-UE)、踝痛穴(BP-UE7)、肩痛穴(BP-LE6)、肘痛穴(BP-LE4)等穴位主要分佈於上下肢，上肢的病變取下肢的相應穴位治療，下肢的病變取上肢的相應穴位治療。
對應取穴原則
對應取穴原則主要是指前後、左右、上下對應的取穴原則。如乳腺穴(BP-B3)為前後對應取穴，偏癱穴(BP-HN4)鼻炎穴(BP-HN6)為左右對應取穴。
男左女右取穴原則
男左女右取穴原則主要是指在人體上治療疾病的穴位有兩個，男性取左側穴，女性取右側穴，而且一次性治療可以治癒疾病的取穴原則。如感冒穴(BP-UE0)、頭痛穴(BP-LE)、腹痛穴(BP-LE5)。
左右交替取穴原則
左右交替取穴原則主要是指未定性疾病，又不能一次治癒，而且是人體有兩個穴位的情況下采取的取穴原則。如痔瘡穴(BP-UE3)、癲癇穴(BP-LE7)。
雙側同時取穴原則
雙側同時取穴原則主要是指急症，又是人體有兩個穴位的情況下采取的取穴原則。如降壓穴(BP-LE)、精裂穴(BP-LE8)。
此外，對非炎症性、滲出性、外傷性、疼痛性疾病，以麻木為主的病症可採取局部取穴原則。如指麻穴(BP-UE)、耳聾穴(BP-LE)以局部取穴為主。
臨床常用平衡穴位
臨床常用的平衡穴位共38個。其中頭頸部平衡穴位9個，上肢部平衡穴位個，胸腹部平衡穴位3個，脊背部平衡穴位3個，下肢部平衡穴位個。
