(1) 口腔衛生狀況：檢查餘留牙及種植義齒表面的菌斑及牙石量，應重點檢查種植體及基臺表面菌斑、牙石沉積情況，尤其是基臺連接處。
(2) 種植體周圍黏膜的檢查：觀察黏膜充血腫脹的程度，有無軟組織增生，有無溢膿和瘻管形成等。
(3) 探診檢查：這是診斷種植體周圍黏膜炎最為重要的檢查，主要探查種植體周圍袋的深度、附著喪失量及探診出血情況。健康種植體周圍的探診深度應≤4mm，過深的探診深度患者可能會有疑問，既然種植體周圍黏膜相對天然牙而言非常脆弱，再去探查是不是會加重損害呢?研究表明，用較輕的力量(約0.25N)探診是不會引起種植體周圍黏膜發生不可逆損傷的，通常，探診導致的上皮附著破壞通常在5~7天即可痊癒。需要指出的是，由於鈦種植體表面容易磨損，探診時必須使用鈍頭塑料探針。
(4) X線檢查：單純的種植體周圍黏膜炎並不引起骨破壞，因此在X線片上無骨吸收表現。進行X線檢查主要是通過觀察是否有種植體周圍骨吸收，以排除種植周圍炎。種植體周圍炎是種植體周圍黏膜炎繼續向深部發展引起支持骨破壞的一種種植體周圍病，它也是形成骨整合後引起種植體喪失的“罪魁禍首”。
(5) 種植體鬆動度的檢查：種植體黏膜炎並不引起種植體鬆動。出現臨床可見的鬆動，往往意味著種植體周圍骨結合已經破壞到無法挽回的地步。目前，可應用種植體動度檢測儀發現種植體周圍骨結合的早期破壞，從而早期判斷種植體周圍黏膜炎是否已發展為種植體周圍炎。
