肺結核引起的肺穿孔主要是病人情況引起的肺泡破裂。治療上可以用採取手術治療，可以做肺部修補術，比較嚴重的須要手術切除肺葉才能保住命。個人護理要注意，勤洗手多喝水注意個人衛生。
對大於3cm的結核球與肺癌難以鑑別時，復治的單側纖維厚壁空洞、長期內科治療未能使痰菌陰轉者，或單側的毀損肺伴支氣管擴張、已喪失功能並有反覆咯血或繼發感染者，可做肺葉或全肺切除。結核性膿胸和(或)支氣管胸膜瘻經內科治療無效且伴同側活動性肺結核時，宜作肺葉-胸膜切除術。手術治療禁忌證有：支氣管粘膜活動性結核病變，而又不在切除範圍之內者;全身情況差或有明顯心、肺、肝、腎功能不全者。
也可以採取化療，一般過程常規採用12-18個月療法，稱“標準”化療，但因療效過長，許多患者不能完成，療效受到限制。自利福平問世後，與其他藥物聯用，發現6-9個月療法(短程化療)與標準化療效果相同，故目前廣泛採用短程化療，但該方案中要求必須包括兩種殺菌藥物，異煙肼及利福平，具有高強殺菌(對A菌群)及滅菌(對B、C菌群)效果。
