1.慢性胃炎 主要症狀為上腹悶脹疼痛、噯氣、食慾減退及消化不良史。纖維胃鏡檢查對慢性胃炎的診斷極為重要，可發現胃黏膜水腫、充血、黏膜色澤變為黃白或灰黃色、黏膜萎縮。肥厚性胃炎可見黏膜皺襞肥大，或有結節並可見糜爛及表淺潰瘍。
2.消化性潰瘍 有潰瘍病史，上腹痛與飲食規律性有關，而膽囊結石及慢性膽囊炎往往於進食後疼痛加重，特別進高脂肪食物。潰瘍病常於春秋季節急性發作，而膽石性慢性膽囊炎多於夜間發病。鋇餐檢查及纖維胃鏡檢查有明顯鑑別價值。
3.胃神經官能症 雖有長期反覆發作病史，但與進食油膩無明顯關係，往往與情緒波動關係密切。常有神經性嘔吐，每於進食後突然發生嘔吐，一般無噁心，嘔吐量不多且不費力，吐後即可進食，不影響食慾及食量。本病常伴有全身性神經官能症狀，用暗示療法可使症狀緩解，鑑別不難。
4.胃下垂 本病可有肝、腎等其他臟器下垂。上腹不適以飯後加重，臥位時症狀減輕，立位檢查可見中下腹部脹滿，而上腹部空虛，有時可見胃型並可有振水音，鋇餐檢查可明確診斷。
5.腎下垂 常有食慾不佳、噁心嘔吐等症狀，並以右側多見，但其右側上腹及腰部疼痛於站立及行走時加重，可出現絞痛，並向下腹部放射。體格檢查時分別於臥位、坐位及立位觸診，如發現右上腹腫物因體位改變而移位則對鑑別有意義，臥位及立位腎X線平片及靜脈尿路造影有助於診斷。
6.遷延性肝炎及慢性肝炎 本病有急性肝炎病史，尚有慢性消化不良及右上腹不適等症狀，可有肝大及肝功不良，並在慢性肝炎可出現脾大，蜘蛛痣及肝掌，B超檢查膽囊功能良好。
7.慢性胰腺炎 常為急性胰腺炎的後遺症，其上腹痛向左肩背部放射，X線平片有時可見胰腺鈣化影或胰腺結石，纖維十二指腸鏡檢查及逆行膽胰管造影對診斷慢性胰腺炎有一定價值。
8.膽囊癌 本病可合併有膽囊結石。本病病史短，病情發展快，很快出現肝門淋巴結轉移及直接侵及附近肝組織，故多出現持續性黃疸。右上腹痛為持續性，症狀明顯時多數病人於右上腹肋緣下可觸及硬性腫塊，B超及CT檢查可幫助診斷。
9.肝癌 原發性肝癌如出現右上腹或上腹痛多已較晚，此時常可觸及腫大並有結節的肝臟。B超檢查，放射性核素掃描及CT檢查分別可發現肝臟有腫瘤圖像及放射缺損或密度減低區,甲胎蛋白陽性。
