1、鼓膜穿孔使中耳與外界相通，在游泳、洗頭或挖耳時細菌容易進入引發中耳炎。如使用不當，還可引起內耳神經功能下降，更難醫治。更為嚴重的是，中耳反覆發炎可導致骨瘍型或膽脂瘤型中耳炎，骨頭受侵蝕時有可能導致面神經癱、腦膜炎、腦膿腫等 顱內外併發症，甚至有生命危險。
2、中耳的保護作用受到了損害，鼓膜是中耳的一側門戶，由它把外耳與中耳隔開，保護著中耳腔。穿孔後外界的細菌、汙水、異物可經穿孔進行中耳引起感染流膿。
3、穿孔使聽力下降：聲音首先振動鼓膜，然後經中耳聽骨鏈傳到耳蝸，進而引起神經反射形成聽力，鼓膜穿孔後，鼓膜有效振動面積減少，外界聲波的能量傳入內耳減弱，出現聽力下降。
4、鼓膜穿孔中較小的穿孔基本不用治療就可以自動癒合，但如果是穿孔較大，會使聲音的有效振動面積減小，引發聽力問題，同時由於失去了鼓膜的屏障保護作用，很多的細菌、病毒、汙水、真菌等有害物質就會長驅直入，爆發很多難以想象的健康危害。
