1.子宮內膜異位症 子宮內膜異位症的痛經呈繼發性、進行性加重，若能觸及典型觸痛結節，有助於診斷。B型超聲檢查有助於鑑別。鑑別困難時應行腹腔鏡檢查。
2.卵巢囊腫 輸卵管卵巢囊腫需與卵巢囊腫鑑別。輸卵管卵巢囊腫除有盆腔炎病史外，腫塊呈臘腸形，囊壁較薄，周圍有粘連;而卵巢囊腫一般以圓形或橢圓形較多，周圍無粘連，活動自如。
3. 卵巢癌 附件炎性包塊與周圍粘連，不活動，有時易與卵巢癌相混淆，慢性炎性包塊多為囊性;而卵巢癌包塊多為實性，較硬，表面不規則，子宮直腸窩可捫及質硬的結節，常有腹水，患者一般情況較差，B型超聲檢查有助於鑑別。診斷有困難時，可藉助於腹腔鏡檢查或病理活體組織檢查。
4.陳舊性宮外孕 多有閉經史及陰道流血，偏於患側下腹痛，婦科檢查子宮旁有粘連的包塊，觸痛，腹腔鏡檢查有助於診斷。
5.結核性盆腔炎 也是慢性疾病，多有其他臟器的結核史，腹痛常為持續性，偶有閉經史，常有子宮內膜結核，腹脹，偶有腹部包塊，X線檢查下腹部可見鈣化灶，包塊位置較慢性盆腔炎高，腹腔鏡檢查活檢可明確診斷。
有時盆腔充血或闊韌帶內靜脈曲張也可產生類似慢性盆腔炎的症狀，也應注意鑑別。
