至今尚未完全清楚。在發開門見山機理上一般認為與免疫、感染及遺傳有關。似屬於第Ⅲ型變態反應,造成結締組織損傷。可能由於微生物(細菌、支原體、病毒等)感染持續地刺激機體產生免疫球蛋白,血清IgA,IgM,IgG增高。部份病人抗核抗體滴度升高。病人血清中存在類風溼因子,它是一種巨球蛋白,即沉澱係數為19S的IgM,能與變性的IgG相互反應,形成免疫複合物,沉積於關節滑膜或血管壁,通過補體系統的激活,和粒細胞、大單核細胞溶酶體的釋放;引起炎性組織損傷。患者血清及關節滑膜液中補體水平下降IgM、IgG及免疫複合物增高,提示本病為一免疫複合物疾病。另外尚有細胞免疫失衡。外周轎中單個核細胞中B淋巴細胞增多;白細胞介素IL-1增多,而IL-2減少。也參與發病機理。
近年來發現少關節類型病兒中與組織相容性抗原HLAB27相關,認為染色體基因遺傳起一定作用。