丙型肝炎病毒感染是致病根本原因，在外界因素的影響下，如飲酒，勞累，長期服用有肝毒性的藥物等，可促進病情的發展。丙肝的病理改變與乙肝極為相似，以肝細胞壞死和淋巴細胞浸潤為主。慢性肝炎可出現匯管區纖維組織增生，嚴重者可以形成假小葉即成為肝硬化。
HCV感染的發病機制主要包括免疫介導和HCV直接損傷兩種，病毒因素包括病毒的基因型、複製能力、病毒多肽的免疫原性等;宿主因素包括人體的先天性免疫反應、體液免疫和細胞免疫反應等。飲酒、免疫抑制劑的使用等因素對HCV的感染病程也有影響。
HCV傳播途徑：接吻、擁抱、噴嚏、咳嗽、食物、飲水、共用餐具和水杯、無皮膚破損及其他無血液暴露的接觸一般不傳播HCV。HCV主要通過以下途徑傳播：
1.血液傳播
(1)經輸血和血製品傳播 由於抗-HCV存在窗口期、抗-HCV檢測試劑的質量不穩定及少數感染者不產生抗-HCV，因此，無法完全篩出HCV陽性者，大量輸血和血液透析仍有可能感染HCV。
(2)經破損的皮膚和黏膜傳播 這是目前最主要的傳播方式，在某些地區，因靜脈注射毒品導致HCV傳播佔60%～90%。使用非一次性注射器和針頭、未經嚴格消毒的牙科器械、內鏡、侵襲性操作和針刺等也是經皮傳播的重要途徑。一些可能導致皮膚破損和血液暴露的傳統醫療方法也與HCV傳播有關;共用剃鬚刀、牙刷、紋身和穿耳環孔等也是 HCV潛在的經血傳播方式。
2.性傳播。
3.母嬰傳播
抗-HCV陽性母親將HCV傳播給新生兒的危險性為2%，若母親在分娩時HCVRNA陽性，則傳播的危險性可高達4%～7%;合併HIV感染時，傳播的危險性增至20%。HCV病毒高載量可能增加傳播的危險性。
4.其他途徑
見於15%～30%的散發性丙型肝炎，其傳播途徑不明。
