潰瘍樣消化不良型，其特點是有消化性潰瘍的症狀而沒有潰瘍的存在，新近研究發現，經常面臨壓力的病人可以產生應激反應，胃酸排洩量間歇性升高，同時胃酸對粘膜損傷的作用時間延長且增加，這是由於運動障礙所致。因此，這種類型的病人可以通過餵食或服用H受體拮抗劑來改善。
運動障礙型消化不良的臨床表現以胃儲留症狀為主，其特點是患者出現難以定位的上腹疼痛或不適，常由進食引起或餐後加重，同時伴有餐後上腹脹痛、早飽、噁心或嘔吐、食慾不佳。
特發性消化不良型，患者的FD症狀不符合上述兩類特徵性消化不良。
器質性消化不良：檢查時能明確指出引起消化不良症狀的器官病變，如肝病、膽道疾病、胰腺疾病、糖尿病等。對於這些病人，治療的重點是病因，藉助於補充消化酶或改善胃腸蠕動來緩解消化不良的症狀。
