1.遺傳因素
目前研究表明抽動障礙與遺傳因素有關，但遺傳方式尚不明確，抽動障礙的病因可能為常染色體顯性遺傳，外顯率受多種因素的影響而不全。此外，在一些家庭中，Tourette綜合徵、其他類型的抽動障礙及強迫症間存在一定的聯繫，因此，提示Tourette綜合徵、其他類型的抽動障礙、強迫症可能為共同的遺傳易患病性(易感性)的不同表達。
2.神經生化因素
抽動障礙與神經生化因素之間的關係非常複雜，且尚無最後定論。抽動障礙患兒可能存在以下異常：①多巴胺活動過度或受體超敏;②蒼白球等部位穀氨酸水平增高;③去甲腎上腺素功能失調;④5-羥色胺水平降低;⑤乙酰膽鹼不足，活性降低;⑥r氨基丁酸抑制功能降低;⑦基底節和下丘腦強啡肽功能障礙。目前，最受關注的是興奮性氨基酸，如穀氨酸和多巴胺系統間相互作用的異常。
3.腦器質性因素
約50%～60%的該障礙患兒存在非特異腦電圖異常;少數患兒存在頭顱CT的異常，如腦萎縮;部分患兒存在左側基底節縮小及胼胝體減小，提示抽動障礙患兒可能存在皮質一紋狀體一丘腦一皮質通路的異常和腦的側化異常;PET研究提示患兒存在雙側基底節、額葉皮質、顳葉的代謝過度。
4.社會心理因素
應激可誘發有遺傳易感性的個體發生該障礙。
5.其他
有研究報道該障礙可能與β溶血性鏈球菌感染引起的自身免疫有關。藥物(中樞興奮劑、抗精神病藥)也可誘發抽動障礙。
