第一，排卵功能障礙，表現為月經週期中無排卵，或雖然有排卵，但排卵後黃體功能不健全。
第二，輸卵管因素。輸卵管過長或狹窄，輸卵管炎症引起管腔閉塞、積水或粘連，均會妨礙精子、卵子或受精卵的運行。輸卵管疾病可佔女性不孕的25%，是不孕的重要原因。
第三，卵巢因素。卵巢發育不全、黃體功能不全、卵巢早衰、多囊性卵巢綜合徵、卵巢腫瘤等影響卵泡發育或卵子排出的因素都會造成不孕。
第四，宮頸病變。宮頸管先天性異常、閉鎖或狹窄、息肉、糜爛、腫瘤、粘連等均可影響精子通過：宮頸粘液中存在抗精子抗體，不利於精子穿透宮頸管或完全使精子失去活動能力。如今，射頻介入治療可以有效的治療宮頸炎、宮頸糜爛及息肉肥大等問題。
第五，生殖器官先天性發育異常或後天性生殖器官病變，阻礙從外陰至輸卵管的生殖通道通暢和功能，妨礙精子與卵子相遇，導致不孕。
第六，免疫學因素。係指女性生殖道或血清中存在有抗精子抗體，引起精子互相凝集，喪失活力或死亡，導致不孕或不育。此外，部分不孕婦女的血清中存在有對自身卵子透明帶抗體樣物質，可阻礙精子穿透卵子受精，亦可引起不孕。
性生活失調、性知識缺乏、全身系統性疾病及不明原因等引起的不孕約佔不孕症病因的1/3左右。
