俗話說：“是藥三分毒”。不過這話並不絕對，羅漢果是國衛生部認定“既是食品又是藥品”的植物，並無其他副作用，只是在使用過程中需要留意以下幾個問題。
羅漢果太甜，容易傷脾胃。羅漢果如用太陽曬乾的可以代茶飲，但不能長期代茶。如果是烘乾的飲多了會上火，風熱咳嗽最好少飲或配其他清熱清涼材料飲用。夢遺、夜尿者忌。短期內飲用無妨，長期飲用會導致胃腸功能的下降，引起連鎖的病理反應。
對於少數寒涼體質的人在使用羅漢果時放入一二片薑片一起泡煮即可中和羅漢果的寒性。但對於體質極其敏感、寒涼的人來說，不建議飲用羅漢果水，建議先找中醫、或者營養師，通過飲食的方法，把體質調整好。
在使用羅漢果泡水時留意不要放入太多羅漢果，500毫升水放入四分之一個羅漢果佳，同時可以放入少許枸杞或紅棗，還有清肝、明目、補血的功效。女性在月事期間也可以適當喝一些羅漢果，但是要留意別喝太多。
考慮到羅漢果果性微涼，小孩、老人、孕婦免疫力低，所以飲用量要適當減少一些，同時可以加少量枸杞一起泡水，益氣健胃，可達到更加的效果，增強身體的免疫功能。
