治療腎結石的目的，是去除結石、保持尿路的通暢，使泌尿系統發揮正常的功能。
去除結石的方法需要根據結石的部位、數目、大小、腎功能、是否合併解剖異常、是否合併感染、以及身體狀態等情況來制定。一般來說，5mm以下的腎結石，以保守治療或觀察為主。5mm~2cm的腎結石，首選體外碎石。特別提醒大家注意的是，不能只憑一次B超結果或X片就進行體外碎石，應當診斷明確後再進行碎石。2cm以上的腎結石首選經皮腎鏡取石。北京大學第一醫院、北京大學泌尿外科研究所在上世紀80年代在國內首先開始進行體外碎石和包括經皮腎鏡取石等各種腎結石的微創治療，已經有近30年的經驗。開放手術取石的應用已經越來越少了，在合併泌尿系統解剖異常時，可以開放手術治療解剖異常同時取石。
腎結石的最佳治療時間
這個沒有相對具體的時間，因為人的身體情況是不一樣的如果籠統是把時間統一起來，是對人生命的不負責。我建議你最好是經常的去醫院檢查下自己的身體，以保證能夠儘快的發現腎結石的症狀，儘早的治好!如果結石不是很大的話，建議可以儘可能的採用保守治療的方法，通過自己堅持不斷的運動，大量的喝水，還有就是對自己飲食各方面營養的合理的控制，保證營養的均衡，也就是食物的酸鹼平衡，在就是結合一些中醫藥膳進行食療，這樣來治療的方式，不過這個方式有一個限制，就是你的結石不能很大，一般的只要不超過0.8cm都可以這樣治療的。如果結石比較大，可以少量的吃點藥物來輔助治療，不宜太多，畢竟再好的藥物它也是藥，是藥三分毒，所以吃的時候一定吃好點的，就是排石效果好點的，儘量的不要影響腎臟的正常功能。
疾病預後
約有50%的腎結石患者在10年內會復發，因此結石的預防非常重要。
結石梗阻造成的腎積水，如果梗阻時間段，在去除結石後腎積水可能完全緩解，腎功能保持正常;如果梗阻時間長，去除結石後腎積水可能部分緩解，受損的腎功能可能難以恢復。
