1.小腸癌鋇劑造影
小腸鋇劑造影可顯示小腸疾病的部位、範圍等，但陽性率較低。氣鋇雙重造影法，特別是插管法小腸氣鋇雙重造影，使對小腸出血性病變的診斷率提高10%～25%。小腸鋇劑造影對血管性病變幾乎沒有任何診斷價值。
2.放射性核素顯像
放射性核素顯像為非創傷性檢查，主要用於小腸出血的定位，其敏感性強於血管造影。其小腸活動性出血診斷陽性率為40%～50%，但有時會出現假陽性。
3.血管造影檢查
小腸疾病尤其是消化道出血時選擇血管造影檢查。此方法是一種有效的診治方法，只要看到造影劑外滲即可做出明確診斷，並同時進行栓塞治療。但此項檢查受失血速度和檢查時機影響，必須在出血活動期將造影劑注入出血部位的供血動脈才能成功。
4.膠囊內鏡
膠囊內鏡的問世，為小腸疾病的診斷帶來了一次革新。膠囊內鏡只有曲別針樣大小，檢查時患者只需像吞服藥物膠囊一樣吞服膠囊內鏡，穿著數據記錄儀背心。吞服膠囊後，經醫生檢測確認膠囊進入小腸後即可離開醫院。整個檢查過程需要8～10小時，檢查後膠囊從肛門自行排出。膠囊內鏡具有安全、無創、依從性好等特點，但其也具有不能進行病理檢查和內鏡下治療的缺點。
5.雙氣囊內鏡
雙氣囊內鏡可彌補膠囊內鏡的缺點，進一步提高了小腸疾病的確診率，對小腸出血、小腸梗阻和不明原因腹痛的確診率較高，目前是小腸疾病診斷的金標準。缺點是檢查時間長，患者痛苦較大。鑑於雙氣囊內鏡操作較費時，對操作者技術要求高，有一定的操作風險，在國內尚未完全普及。
6.CT仿真內鏡
利用螺旋CT薄層無間隔掃描和計算機三維重建，即可獲得類似內鏡的動態重建圖像。其侷限性是不能觀察黏膜顏色變化，對淺表細微結構變化不能分辨，不能進行活檢及鏡下治療。
7.剖腹探查
是最直接有效的辦法，但對人的損害也是最大的。
