1、美尼爾氏綜合徵
該病為內耳淋巴代謝失調，以交感神經過度興奮為主徵，如頭痛、眩暈，噁心、嘔吐、耳鳴、耳聾。眼震，脈緩及血壓低等。但其發作與大腦皮層機能失調，過度疲勞，睡眠不足，情緒波動有關，而非頸部活動所誘發，且緩解後無任何症狀；發作來勢迅猛，持續數小時至數天，不像頸椎病為一過性；無神經系統和腦幹缺血徵；發作期有規律性水平性眼球震顫。
2、鎖骨下動脈偷漏綜合徵（Subclavian steal syn-drome）
鎖骨下動脈偷漏綜合徵是鎖骨下動脈的阻塞病變，如動脈硬化，先天畸形，外傷，血栓等使椎動脈、頸總動脈與上肢動脈間形成側枝循環，當上肢運動時，腦部血流大量逆流到上肢去，因而產生腦缺血徵，如乏力疼痛，橈動脈搏動減弱或消失，手指發鉗；患側血壓低，收縮壓可相差2.7~9.3kPa；患肢運動可誘發；鎖骨上窩可聽到收縮期雜音，動脈造影可確診。
3、耳內聽動脈栓塞
內聽動脈栓塞可以引起突發性耳鳴耳聾及眩暈，症狀嚴重且持續不減，可達數年甚至終身。
4、腦動脈硬化
腦動脈硬化也可出現頭暈，肢麻，病理反射。鑑別應有大腦皮層功能減退症狀，如頭暈、記憶減退和睡眠障礙三大症狀，且症狀消長與頸椎無關；全身有動脈硬化徵，如眼底動脈，主動脈，冠狀動脈，胃動脈等；血酯增高，腦血流圖有恆定的缺血性改變，並無頸椎病症狀及體徵。
5、神經官能症
神經官能症主訴多，體徵少；多為大腦皮層功能減退症狀如頭痛、頭暈，失眠，記憶力減退等；非發作性和一過性；症狀與情緒變化有密切關係；無頸椎症狀和X線徵。
6、青光眼
可有同側偏頭疼，眼眶部痠疼和噁心、嘔吐，眼科檢查可以發現視力減退，還可出現紅視。
7、交感型頸椎病
椎動脈型頸椎病和交感神經型頸椎病本身的診斷存在爭議，又由於解剖和生理病理原因，椎動脈型頸椎病與交感神經型頸椎病在病因及臨床表現上有很多交叉之處，這就給臨床上對椎動脈型頸椎病與交感神經型頸椎病鑑別造成了困難。
首先，在臨床表現上椎動脈型側重的是血管受壓、供血不足的症候，交感型則表現為交感興奮或抑制的症狀，患者出現不同節段交感神經反射症狀，如視覺障礙、耳鳴眼球震顫、肌力減弱、腱反射亢進等複雜證候，也稱Barre-Lieou症候群。這與參加反射的節後纖維的受累性質與數量密切相關。交感型頸椎病導致的不典型心絞痛即是其中特殊類型之一。交感神經型頸椎病的症狀不僅有椎動脈型頸椎病的表現，而且還有其他交感神經功能紊亂的症狀，即交感神經興奮或抑制症狀，
如頭痛、頭暈、心動過速、肢體發涼等，或心動過緩、血壓偏低、胃腸蠕動加強、流淚、鼻塞等，有近1/3的患者沒有頸椎病的其他症狀。其次，在輔助檢查上交感神經型頸椎病血管造影無椎動脈狹窄，以與椎動脈型椎病相鑑別。還發現在椎動脈型頸椎病和交感型頸椎病這二型頸椎病中，彩色多普勒超聲檢查的結果是不同的，其中椎動脈型頸椎病的阻力指數(RI)、搏動指數(PI)均比交感型頸椎病患者高。最後，在診斷性治療手段上，椎動脈型需用椎動脈造影或核磁共振椎動脈顯影，交感神經型需用頸椎高位硬膜外封閉或頸交感神經封閉等方法有效進一步鑑別。
