1.美尼爾綜合徵：
本病為內耳淋巴代謝紊亂，以交感神經過度興奮為主要表現，如頭痛眩暈、噁心、嘔吐、耳鳴、耳聾。眼球震顫，脈搏緩慢，血壓低。但其發作與大腦皮層功能紊亂、過度疲勞、睡眠不足、情緒波動有關，而不是由頸部活動誘發，緩解後無症狀；發作迅速，持續數小時至數天，不像頸椎病是一過性的；無神經系統和腦幹缺血徵象；發作時有規律的水平眼震。
2.鎖骨下盜血癥：
鎖骨下盜血癥是指鎖骨下動脈的阻塞性病變，如動脈粥樣硬化、先天性畸形、外傷或血栓形成等，造成椎動脈、頸總動脈和上肢動脈之間的側支循環。腦缺血的症狀，如乏力和疼痛，橈動脈搏動減弱或消失，手指被夾住；患側血壓低，收縮壓差為2.7～9.3千帕；患肢活動可誘發；鎖骨上窩可聽到收縮期雜音，動脈造影可確診。
3.耳內聽動脈栓塞：
耳內聽動脈栓塞可引起突發性耳鳴耳聾和眩暈，症狀嚴重且持續多年甚至終身。
4.腦動脈硬化：
腦動脈硬化也可出現眩暈、肢體麻木和病理反射。區別應是皮質功能減退的症狀，如頭暈、記憶力減退和睡眠障礙三大症狀，而症狀的消退與頸椎無關；全身有動脈硬化的體徵，如眼底動脈、主動脈、冠狀動脈、胃動脈等；血酯增多，腦血流圖有持續的缺血性改變，而無頸椎的症狀和體徵。
5.神經衰弱：
神經衰弱主訴多，體徵少；多為皮質功能減退症狀，如頭痛、頭暈、失眠、記憶力減退等；非外顯性、短暫性；症狀與情緒變化密切相關；無頸椎症狀和X線徵象。
6.青光眼：
可能有同側偏頭痛、眼眶痠痛和噁心嘔吐，眼科檢查可發現視力下降，也可發現紅眼病。
7.交感神經型頸椎病。
椎動脈型頸椎病和交感神經型頸椎病的診斷本身就有爭議，由於解剖學和生理學的原因，椎動脈型頸椎病和交感神經型頸椎病在病因和臨床表現上有很多交叉，這給臨床上對椎動脈型頸椎病和交感神經型頸椎病的認識。
椎動脈型頸椎病的病因是甚麼？
首先，椎動脈型側重於血管壓迫和供血不足，而交感型則表現為交感神經興奮或抑制的症狀，患者在不同節段出現交感神經反射的複雜症狀，如視覺障礙、耳鳴眼球震顫、肌肉無力、腱反射亢進，也稱為Barre-Lieou綜合症。這與參與反射的節後纖維的性質和數量密切相關。交感神經型頸椎病引起的非典型心絞痛是其中一種特殊類型。交感神經型頸椎病的症狀不僅包括椎動脈型頸椎病的表現，還包括交感神經功能紊亂的其他症狀，即交感神經興奮或抑制，如頭痛、頭暈、心動過速、四肢發涼等，或心動過緩、低血壓、胃腸道運動增強、流淚、鼻塞等。近1/3的患者沒有其他頸椎病的症狀。其次，在輔助檢查中交感神經型頸椎病血管造影無椎動脈狹窄，以區別於椎動脈型頸椎病。彩色多普勒超聲檢查也發現椎動脈型頸椎病和交感神經型頸椎病兩種類型的頸椎病有差異，其中椎動脈型頸椎病患者的阻力指數（RI）和脈動指數（PI）高於交感神經型頸椎病患者。最後，在診斷治療手段上，椎動脈型需要椎動脈造影或MRI椎動脈顯像，交感型需要通過頸椎高位硬膜外封閉或頸交感神經封閉來進一步有效區分。
