從遭到艾滋病病毒感染， 到體內產生出艾滋病病菌抗體，這一段時間稱作窗口期。從感染愛滋病病菌的時刻開始，3-6個月內，叫窗口期，這個時間內，任何血液檢測都查不出來，感染者自己跟正常人完全相同，自己也不大可能確定感染。若在這個時期內獻血，血站查不出來，會告訴你完全正常，你的血液亦會被用在救人，當然，艾滋病病毒就此進到他人身體，被輸血者也進入窗口期。
同時，在窗口期，艾滋病病毒感染者的血液檢驗查不到艾滋病病毒抗體，結果呈陰性。窗口期的長短個體有差別，通常2周到6周，平均為30天(尿檢試紙的窗口期亦為2-6周)，惟有極個別人的窗口期長達3-6個月(但該種機會萬分之一都不到)。在感染階段，最先出現的是病毒RNA，此是可以使用PCR的辦法檢驗出來，以後出現的是IgM抗體，應用雙抗原夾心法便可以檢驗出來，之後出現的是IgG抗體，應用間接法能夠檢驗出來，現在供應的金標試紙條是雙抗原夾心法，最短在感染6天以後就能夠檢驗出來，絕大多數樣本的窗口期在2-4周內，大多數人在1個月後都能夠查出，若是高危行為過了2個月仍不能檢驗出來，基本上沒有感染的可能了。
從感染時刻開始，過了窗口期的6個月之後，8-10年內，叫潛伏期。這個時期，身體沒有反應，跟正常人相同，但能經過艾滋病病毒檢測查出你感染了艾滋病病毒。若在這個時期內獻血，血站會檢出來。
