1.脾痺(心痛)：以胸悶短氣或發作性心胸疼痛為主，常於勞累後發作，多無胸骨：後燒灼感及吞嚥困難。心電圖示ST-T呈缺血性改變。食管滴酸試驗陰性。
2.食管癌、食管痺：以噎膈為主症，食管鏡檢及X線吞鋇檢查可作鑑別。
3.胃瘍：疼痛多位於胃脘部，常呈慢性、節律性、季節性與週期性發作，X線鋇餐及纖維胃鏡檢查在胃或十二指腸球部可見潰瘍病變。
4.心絞痛：食管炎的肌性疼痛與心絞痛可單獨存在，有時同時存在，均可用硝酸甘油等緩解，鑑別很困難。心源性疼痛常橫向胸部放射，而食管性疼痛垂直放射。兩種類型的疼痛均能被運動突然引起，但改變體位用力時可發生反流，而持續不用力的運動可造成心絞痛。
5.癔症球：是指病人主訴喉部有異物感，不能起始吞嚥，有堵塞感，臨床檢查未見器質性病變。認為是胃部高位反流造成食管上部刺激所致。有時為少數病人的僅有的症狀而導致誤診。
