一、遺傳因素
多數腦癱病例為非遺傳因素所致，但是某些類型腦癱有遺傳傾向。關於遺傳因素在腦癱病因中所佔的比例問題，自從Little和Freud時代就爭論不休，至今仍然沒有確切答案。
非痙攣性腦癱約佔腦癱的15%且具有遺傳傾向的可能性最大。三分之一的共濟失調型腦癱可能是常染色體隱性遺傳，尤其是對伴有智力障礙者。痙攣性雙癱和四肢癱患兒的家族成員有10%的再發危險性，症狀對稱者危險性更大並且大多數是常染色體隱性遺傳。手足徐動型和肌張力低下型腦癱的再發危險性不清楚。先天性氨基酸和有機酸代謝異常者罹患腦癱的危險性明顯增加。例如，高血氨昏迷恢復後尿素循環仍異常者可能易患痙攣性四肢癱;有I型戊二酸血癥者易患錐體外束型腦癱。一般受累家庭再發腦癱的危險性約為10%。家中若有智力低下患者，發生腦癱的危險性增加到了5倍。同時，低家庭收入及經產婦也都是小兒腦癱的重要危險因素。
二、母親因素
(一)社會階層
有關社會階層與腦癱關係的研究不多且結果不一致。Dowding VM等根據母親職業將社會階層分為如下五級：①各級專業技術人員;②其他非體力工作人員;③技術性體力工作者;④體力工作者(含半技術性體力工作者);⑤未婚者。軍人、失業者和職業不詳者歸一類，不列人分析。結果顯示痙攣性偏癱和雙癱的患病率隨著社會階層下降而上升，尤其是痙攣性雙癱;而其他類型的腦癱與社會階層之間不存在這種關聯;對於低出生體重兒，當調整體重以後腦癱患病率與社會階層之間沒有顯著關聯，而對於正常出生體重兒(>2500g)則不然，上述關聯依然存在。
(二)暴露於環境有害物質
孕婦暴露於原子彈爆炸後的放射線可以導致小頭畸形、智力障礙和腦癱。在妊娠中期，對骨盆腫瘤進行放射治療也可以產生同樣效果。在日本由於工業廢物汙染，龜肉食品中含有甲基汞(Methvlmercury)，在孕期食用這種食品可以引起痙攣性四肢癱;在伊拉克食用受殺真菌劑汙染的麵包也可以產生同樣效果。
(三)宮內感染
各種病原體包括細菌、病毒、原蟲、支原體及真菌等，均可通過不同途徑感染宮內胎兒。其途徑有上行和經胎盤兩種。正常孕婦的陰道和宮頸內有大量的細菌，包括某些條件致病菌。在孕婦發生泌尿道或生殖道感染時，可上行感染胎兒;一些病毒如單純皰疹病毒、鉅細胞病毒等，也可發生上行性感染;一旦胎膜破裂宮內感染則更容易發生。不同的病原體穿過胎盤的能力不同。大多數病毒很容易穿過胎盤，孕婦感染的病毒可經胎盤通過血行使胎兒感染。而如梅毒螺旋體以及李斯特菌等細菌在妊娠晚期很難穿過胎盤。胎兒宮內感染的結局與病原體的特性、感染的程度、時間等因素有關，可分別造成流產、先天畸形、發育遲緩及新生兒疾病等。
宮內弓形體感染和病毒感染如風疹病毒、鉅細胞病毒感染，能夠導致中樞神經系統損傷引起腦癱。最常見的是痙攣性四肢癱。由於風疹病毒疫苗的研製和使用，鉅細胞病毒感染成為最常見的病毒感染。在所有感染者中，約10%的小兒罹患腦癱，尤其是在伴有腦積水時。
