1.外周血白細胞計數正常或偏低，有時白細胞可以升高。
2.腦脊液檢查腦脊液壓力增高，外觀多清亮，白細胞總數增加，多在300×10^6/L以下，以淋巴細胞為主。病毒性腦炎的檢查下少數患兒腦脊液白細胞總數可正常。病毒性腦炎患兒腦脊液蛋白質大多輕度增高或正常，糖和氯化物無明顯改變。塗片或細菌培養均陰性。
3.病毒病原學診斷
目前有關病毒性腦炎的病原學檢查主要有：①病毒分離：對於不同的病毒可以從不同標本中進行病毒分離，提供病原學證據，具有病毒性腦炎的確診價值。如腦脊液(腸道病毒、單純皰疹病毒、腮腺炎病毒)、唾液、糞便(脊髓灰質炎病毒、輪狀病毒)、尿、皮損等。②血清學檢測：包括酶聯免疫方法、免疫熒光法等，用於病毒鑑定、病毒抗原檢測、特異性病毒抗體(IgM或IgG)檢測。③分子生物學方法：常用的有聚合酶鏈反應(PCR)、實時PCR及生物芯片技術等，可從患兒腦組織和腦脊液中檢出病毒DNA序列，從而確定病原。
4.腦電圖
主要表現為高幅慢波，多呈瀰漫性分佈，可有癇樣放電，對病毒性腦炎的診斷有參考價值。但腦電圖表現無特異性，不能判斷病原。腦電圖正常不能完全排除腦炎。
5.影像學檢查主要用於評估中樞神經系統受損的程度，MRI優於CT.在嚴重病例中，CT和MRI均可顯示炎性病灶形成的大小不等、界限不清、不規則低密度或高密度影，輕症可無明顯異常改變。
