1.病毒性腦膜炎 急性起病，或先有上感或前驅傳染性疾病，主要表現為發熱，噁心，嘔吐，軟弱，嗜睡，年長兒會訴頭痛，嬰兒則煩躁不安，易激惹，一般很少有嚴重意識障礙和驚厥，可有頸項強直等腦膜刺激徵，但無侷限性神經系統體徵，病程大多在1～2周。
2.病毒性腦炎 起病急，但其臨床表現因主要病理改變在腦實質的部位，範圍和嚴重程度而有不同，病毒性腦炎病程大多2～3周。
(1)大多數患兒在瀰漫性大腦病變基礎上主要表現為發熱，反覆驚厥發作，不同程度意識障礙和顱壓增高症狀，驚厥大多呈全部性，但也可有局灶性發作，嚴重者呈驚厥持續狀態，患兒可有嗜睡，昏睡，昏迷，深度昏迷，甚至去皮質狀態等不同程度意識改變，若出現呼吸節律不規則或瞳孔不等大，要考慮顱內高壓併發腦疝可能性，部分患兒尚伴偏癱或肢體癱瘓表現。
(2)有的患兒病變主要累及額葉皮質運動區，臨床則以反覆驚厥發作為主要表現，伴或不伴發熱，多數為全部性或局灶性強直-陣攣或陣攣性發作，少數表現為肌陣攣或強直性發作，皆可出現癇性發作持續狀態。
(3)若腦部病變主要累及額葉底部，顳葉邊緣系統，患者則主要表現為精神情緒異常，如躁狂，幻覺，失語以及定向力，計算力與記憶力障礙等，伴發熱或無熱，多種病毒可引起此類表現，但由單純皰疹病毒引起者最嚴重，該病毒腦炎的神經細胞內易見含病毒抗原顆粒的包涵體，有時被稱為急性包涵體腦炎，常合併驚厥與昏迷，病死率高。
