1、細菌、病毒：通常誘發扁桃體炎最根本的病因便是細菌、病毒，而誘發扁桃體炎最常見的致病菌便是鏈球菌。
2、抵抗力低下：當人體抵抗力低下時，極易導致扁桃體炎的發生，諸如兒童、患有慢性疾病的病人，以及精神壓力過大的工作一族等。
3、季節因素：通常扁桃體炎的病發，與季節也有一定的聯繫，諸如換季時，氣溫起伏過大，導致身體免疫力出現異常，最終誘發扁桃體炎的發生。
4、鄰近器官組織炎症：諸如咽喉部位疾病、鼻部疾病以及耳部疾病，都可能導致炎症蔓延至扁桃體，造成扁桃體炎的病發。
5、身體其他疾病：諸如支氣管炎、氣管炎、肺炎等疾病，以及營養不良等的急慢性炎症，也極易導致扁桃體炎的發生。
慢性扁桃體炎時，隱窩內上皮壞死脫落，細菌及炎性滲出物聚集其中，隱窩可產生小潰瘍及瘢痕形成而引流不暢，適於細菌生長繁殖，故感染不易消除。屢發急性扁桃體炎，使機體抵抗力降低或治療不徹底，則更易轉為慢性。
急性扁桃體炎常發生於兒童及青少年。主要致病菌為乙型溶血性鏈球菌，葡萄球菌，肺炎雙球菌。腺病毒也可引起本病。當機體抵抗力因寒冷，潮溼，過度勞累，體質虛弱，菸酒過度，有害氣體刺激等因素驟然降低時，細菌繁殖加強所致。有時則為急性傳染病的前驅症狀，如麻疹及猩紅熱等。
