1.一般先天性心臟病中僅有少數類型的先天性心臟病可以自然恢復，有的則隨著年齡的增大，併發症會漸漸增多，病情也逐漸加重。
選擇何種治療方法已經選擇正確的手術時機，主要取決於先天性心臟畸形的範圍及程度。簡單而輕微的畸形如房間隔缺損、單純肺動脈瓣狹窄，如缺損直徑小，則對血流動力學無明顯影響，可以終身不需任何治療。嚴重的先天性心臟病如完全性大動脈轉位或左心發育不良綜合徵，在出生後必須立即手術，否則患兒將無法生存。
2.保守觀察的先天性心臟病病例。
(1)直徑較小、無肺高壓傾向的繼發孔房缺者，可觀察到3～5歲再手術;
(2)直徑小於4毫米的膜部室間隔缺損，對心功能影響輕，並且有自動閉合的可能，所以也可以觀察到3～5歲，如室缺仍未能閉合則應考慮手術治療。由於小室缺有誘發細菌性心內膜炎的可能，而目前外科手術安全性己非常高，所以目前多不主張較長時間等待;
(3)跨瓣壓差小於40mmHg的主動脈瓣、小於60mmHg的肺動脈瓣狹窄。這些病例採用保守治療的前提是，必須在有較高先心外科治療水平的醫院檢查心臟超聲兩次以上，另外在觀察期間需定期進行隨訪觀察和必要的檢查，以免造成誤診而貽誤治療時機。
3.選擇合適的手術時機是先心病手術成功並取得良好預後的關鍵。
目前，確定手術時機有幾個主要因素：
(1)先心病自身的病理特徵及對血流動力學的影響程度 一般講，畸形越複雜，對血流動力學影響越大，越應儘早手術治療。
(2)繼發性病理改變的進展情況 左向右分流類先心病，應爭取在發生肺血管阻塞性改變之前進行手術矯治。發紺性、梗阻性先心病應爭取在發生嚴重心肌肥厚、纖維變性前手術。
4.先天性心臟病的治療方法：
有手術治療、介入治療和藥物治療等多種。選擇何種治療方法以及甚麼時候最適宜手術應根據病情，由心臟專科醫生針對患兒的具體情況提出建議。無分流類或者左到右分流類，經過及時通過手術，效果良好，預後較佳。右至左分流或複合畸形者，病情較重者，手術複雜困難，部分患者由於某些心臟結構發育不完善而無法完全矯正，只能行姑息性手術減輕症狀、改善生活質量。
介人治療大致分為兩大類：一類為用球囊擴張的方法解除血管及瓣膜的狹窄，如主動脈瓣狹窄、肺動脈瓣狹窄、主動脈縮窄等;另一類為利用各種記憶金屬材質的特質封堵器堵閉不應有的缺損，如房間隔缺損、室間隔缺損、動脈導管末閉等。由於醫學技術的進步和的材料及工藝不斷研究與完善，介入治療目前在國內外臨床應用得到進一步的發展，不僅可避免開胸手術的風險及創傷，而且住院時間短、恢復快，是非常有效的治療方法。介入性治療部分代替了但還不能完全替代外科手術開胸手術，該技術有嚴格的適應證。
先心病的外科手術方法主要根據心臟畸形的種類和病理生理改變的程度等綜合因素來確定，手術方法可分為：根治手術、姑息手術、心臟移植三類。
(1)根治手術 可以使患者的心臟解剖回到正常人的結構。
(2)姑息手術 僅能起到改善症狀的作用而不能起到根治效果，主要用於目前尚無根治方法的複雜先心病，如改良Glenn、Fontan手術、或者作為一種預備手術，促使原來未發育完善的結構生長髮育，為根治手術創造條件，如體—肺分流術等。
(3)心臟移植 主要用於終末性心臟病及無法用目前的手術方法治療的複雜先心病。
