腺病毒引起的急性呼吸道疾病，在兒童中以發熱性咽炎和咽結膜熱為最常見，嬰幼兒則以肺炎為多。潛伏期3～8天，繼上呼吸道感染，咽結膜熱或其他呼吸道傳染病後發病。發熱高，病程長為其特點。一般急驟發熱，最初1～3天，體溫多在38～39℃，以後漸升高，4～5天半數病例可達40℃以上，呈稽留熱或不規則熱型，高熱持續7～10天，重症2周為極期以後退熱，個別病例發熱時間長達20天。中毒症狀重。精神萎靡，面色蒼白，發灰，這可能與中毒致末梢血管收縮及病毒血症引起全身病變有關。
根據表現，臨床可分為輕症和重症。
輕症：多見學齡前期及學齡期兒童，早期有結膜炎，咽炎及皮疹等腺病毒感染的症狀，熱程短，持續7～14天，中毒症狀輕，一般無心、腦等合併症。肺部體徵與X線與一般支氣管肺炎近似，病程10～14天，高熱驟降，一般症狀隨著很快好轉，肺部陰影2～4周才能完全消失。
重症：中毒症狀重，高熱可長達3～4周，大部分有循環和中樞神經系統及DIC等合併症，肺部病變長達1～4個月之久，肺部溼囉音長時間不消失。極重型可發生DIC。
腺病毒性肺炎時，若在發病後高熱持續10～14天以上而不見好轉，或熱已有下降趨勢後又覆上升，或病情一度減輕而又惡化時，應注意有繼發細菌感染的可能。Korppi觀察報告，在呼吸道腺病毒感染累及下呼吸道，特別是肺炎時，合併細菌感染是常見的。此時痰呈黃色，痰液或咽拭子細菌培養陽性，常見致病菌為金黃色葡萄球菌，肺炎球菌，大腸桿菌等。此時若行X線檢查可見肺部病變增多或出現新的病變。末梢血白細胞及中性粒細胞增高，核左移或粒細胞出現中毒顆粒。病情較一般腺病毒性肺炎更為嚴重。
此外，腺病毒性肺炎患兒還可合併呼吸道合胞病毒(RSV)或副流感病毒感染，此時患兒病情也較單純腺病毒性肺炎時嚴重。
病情的嚴重程度及預後與年齡、病毒型的毒力、免疫功能、是否繼發細菌或其他病毒感染均有關。如年幼兒腺病毒感染較年長兒重;7型較3型為重;21型可留下遠期肺部損害，如肺不張、肺纖維化，這種損害可能是閉塞性毛細支氣管炎所造成。
