抗精神病藥物可在許多方面產生副作用，這些副作用可因藥物種類、劑量或個別病人而異，但大多數有常見的副作用，有些在用藥後短期內發生，有些在長期使用後發生。
1.藥物的抗膽鹼能和抗腎上腺素能作用引起以下副作用：
口乾、視力模糊、便秘、尿瀦留、心率加快、肥胖、月經紊亂和泌乳。
2.神經系統症狀：
錐體外系症狀突出。短期用藥可出現急性肌張力障礙、不能靜坐和帕金森樣綜合徵；長期用藥可導致延遲性運動障礙。
①急性肌張力障礙（Acute Dystonia）在青少年中最常見，特別是使用氟化抗精神病藥物時，在用藥後幾天內發生，以眼、面、口、頸和軀幹肌肉的局部痙攣為特徵。通過肌肉注射氫溴酸東莨菪鹼0.3至0.5毫克，症狀可迅速緩解。
②坐不住（Akathisia）：發生率為20-40%，中年婦女較多，多發生在用藥的第2-3周，表現為煩躁不安，坐不住或躺不住，反覆行走或原地踏步，可伴有不自主運動。治療方法與急性肌張力障礙相同，也可試用安定劑或胰島素。
③帕金森綜合徵（Parlinsoniansydrome）：非常常見，容易發生在婦女和老年患者身上，特點是運動緩慢或不能運動，靜止性震顫和肌張力增加。抗膽鹼能藥物是有效的。上述症狀是可逆的，如果停藥或減藥可能會消失。
④延遲性運動障礙（Tardivedyskinesia）：由長期大劑量抗精神病藥物引起的一種特殊而持久的錐體外系反應，可能在用藥3個月後才發生，發病率為15%～40%，女性多於男性。其中最常見的是口-舌-頰三聯徵（BLM綜合徵），嚴重時可引起口齒不清，影響進食。
它還可表現為四肢不自主地搖擺，手指跳舞般的運動，心動過速，或四肢和軀幹的扭曲。它的治療比較困難，除加強預防外，早發現、早治療尤為重要，有些人用左旋多巴進行 "脫敏 "治療，短期內症狀加重，停藥2-3周後，症狀逐漸好轉。目前尚無有效措施。
3.皮膚症狀：
由於過敏常發生在治療的前4周，一般表現為紅色丘疹，開始在手和麵部等暴露部位，也可延伸到軀幹，對稱分佈，嚴重者出現皰疹、剝脫性皮炎、皮膚糜爛等。應立即停用該藥。
4.肝臟損害：
由於氯丙嗪引起的膽汁淤積性黃疸的發生率約為0.1%。無黃疸型肝炎比這更常見。它是由過敏引起的，停藥後1至2周內可恢復，臨床上應與傳染性肝炎相鑑別。
5.消化道症狀：
該藥引起平滑肌張力下降。可引起麻痺性腸道硬化，長期用藥過量時可能會出現這種情況。
6.心血管症狀：
體位性低血壓很常見，多發生在治療初期，尤其是用藥後的第一週，與該藥阻斷外周α-腎上腺素受體有關。心動過速和心電圖異常相當常見，主要表現為S-T段壓低、Q-T延長、T波增寬或倒置? 和對症處理。
7.造血系統的副作用較少：
藥物引起的粒細胞減少症的發生率為0.1%～0.7%，其中氯氮平引起的比率較高，屬於代謝性免疫反應。通過早期診斷和及時處理，預後大多良好，但嚴重的病例如果處理不當可能導致死亡。
8.其他：
Malignantsyndrome是一種嚴重的副作用。多在大量用藥後出現，表現為高熱、震顫、肌強直、吞嚥困難等錐體外系症狀，心動過速、出汗、排尿困難、血壓波動等植物性症狀，部分患者伴有意識障礙。該病的病程是急性的，處理不當會導致具象化。江宗寧（1988）報道，在抗精神病藥物治療期間的猝死病例中，同期醫院死亡病例中有3.9%是由於各種原因造成的機械性窒息，其中約1/3是由於機械性窒息造成的。但在一些猝死的病人中，屍檢並沒有發現致病的病因。
