1、細菌、病毒。扁桃體炎最常見的原因是細菌、病毒，而扁桃體炎最常見的致病菌是鏈球菌。
2.抵抗力低下。當人體抵抗力低下時，容易導致扁桃體炎，如兒童、慢性病患者、工作壓力大的人等。
3、季節性因素。扁桃體炎的發病通常與季節有關，如季節交替時，氣溫波動過大，導致人體免疫力異常，最終引發扁桃體炎的發病。
4.鄰近器官和組織的炎症：喉嚨、鼻子和耳朵的疾病會導致炎症擴散到扁桃體，導致扁桃體炎。
5.其他身體疾病：支氣管炎、氣管炎、肺炎等疾病，以及營養不良等急慢性炎症，都容易導致扁桃體炎。
慢性扁桃體炎時，隱窩內上皮壞死脫落，細菌和炎性滲出物聚集其中，隱窩內可產生小潰瘍和瘢痕形成，引流不暢，適合細菌生長繁殖，故感染不易消除。而在這一過程中，由於 "小三陽 "的出現，使得 "小三陽 "的治療效果大打折扣。
急性扁桃體炎經常發生在兒童和青少年身上。主要致病因素是溶血性鏈球菌、葡萄球菌和肺炎雙球菌。腺病毒也可以引起這種疾病。當身體的抵抗力因寒冷、潮溼、過度勞累、虛弱、菸酒過度以及有害氣體的刺激而突然下降時，細菌的繁殖就會加強。有時它是急性傳染病的前兆，如麻疹和猩紅熱。
