（1）精神分裂症併發結核病：由於精神分裂症患者有懶散、退縮、飲食不積極、孤僻等症狀，常導致營養狀況下降，身體抵抗力差，容易併發結核病，如肺結核和腸結核。第一步是諮詢精神病醫生和結核病醫生，以確定每種疾病的嚴重程度。如果精神分裂症已經穩定，而結核病仍在活動，則應在結核病醫院住院治療，由精神病醫生提供具體的精神病治療方案；如果情況相反，則應在精神病醫院治療；如果兩種疾病都很嚴重，則應由兩科醫生通過會診。當兩種疾病都很嚴重時，治療起來就非常棘手，存在很大的矛盾。例如，肺結核需要充分的休息，而精神分裂症患者往往興奮激動，或以幻覺、妄想為主，到處亂跑，促使肺結核惡化；嚴重的肺結核患者身體衰弱，這樣，用藥物進行精神治療受到很大限制。因此，這類病人必須及時送入醫院，由有經驗的醫生進行治療。目前，中國較大的精神病院都有可以治療這類病人的結核病房。20世紀50年代以前，精神分裂症患者的結核病發病率很高，但近20年來，隨著精神病醫療水平的提高和精神病學的發展，併發結核病的精神分裂症發病率逐年下降。
（2）精神分裂症合併肝病：較好的精神病院設有結核病和肝炎的傳染病病房，當精神分裂症合併傳染性肝炎時，可在精神病院進行住院治療。必須指出的是，精神分裂症和傳染性肝炎在治療方面有很大的衝突。這是因為所有治療精神分裂症的藥物都要通過肝臟解毒：在肝炎使肝功能下降或失效的基礎上_，藥物會進一步加重肝臟的負擔，使肝功能惡化；而不治療精神分裂症，病人的興奮和煩躁同樣會導致肝功能衰竭，所以治療必須權衡利弊。
（3）精神分裂症合併心臟病：一些抗精神病藥物可加重心力衰竭；反之，心臟病可大大限制精神分裂症的治療。因此，抗精神病藥物的使用取決於心臟功能，病人的治療方案_在住院後_應由有經驗的醫生來制定。
