小兒支原體感染，首先出現咽炎、鼻炎、氣管炎、肺炎等。常有發燒、頭痛、咳嗽、全身不適。體溫常達39℃左右，發燒時間可長達1-2周。咳嗽初期為乾咳，後轉入頑固性劇烈咳嗽，無痰或少痰。嬰幼兒表現為喘憋和呼吸困難。支原體感染除引起嚴重肺炎外，還可引起心肌炎、腦炎、肝炎、血小板減少、腎臟捐害等。
肺炎支原體感染的治療，主要是大環內酯類藥物紅黴素或阿奇黴素。療程短則1-2周，長則3-4周，甚至更長。因為肺炎支原體抗體檢測受感染時間限制，對疑似近期感染者，在未取得檢測結果前，經驗性選擇大環內酯類藥物治療，是十分必要的。經有效抗生素治療可縮短病程，減輕症狀，減少併發症的發生。如治療不徹底，不能完全清除病原體則病情易復發，甚至可從患兒呼吸道分泌物中分離出肺炎支原體達數月之久，從而成為感染的傳播者。
若不見效可要求醫生更換藥物，靜脈注射病情穩定後醫生會開相應口服用藥(一般是阿奇黴素和營養類藥物)，必須按照醫囑準時足量服用。該病治療時間較長，家長必須耐心，長時間的治療才能完全徹底治療。另外，不能吃甜、過鹹、油炸、油膩、酸、冷、硬的食物，可多吃一些流食、清淡(如稀飯、米粥、燒青菜)的食物，平時還要多喝水或果汁(果汁要加水)，還可以做點瘦肉粥、魚肉粥之類的。
