病毒分型
已確定埃博拉病毒分4個亞型，即埃博拉-扎伊爾型（EBO-Zaire）、埃博拉-蘇丹型（EBO-Sudan）、埃博拉-萊斯頓型（EBO-R） 和埃博拉-科特迪瓦型（EBO-CI）。EBO-Z和EBO-S對人類和非人類靈長類動物的致病性和致死率很高；EBO-R對人類不致病，對非人類靈長類動物具有致死性作用；EBO-CI對人類有明顯的致病性，但一般不致死，對黑猩猩的致死率很高。
1、扎伊爾埃博拉病毒
扎伊爾埃博拉病毒有高達90％的致死率，在流行地區死亡率1976年為88％、1977年為100％、1994年為59％、1995年為81％、1996年為73％、2001年至2002年為80％，2003年則是90％，2007年平均為83％。
1976年8月26日首次於扎伊爾北邊城鎮爆發，首位個案紀錄為44歲教師Mabalo Lokela，當時他的高燒被診斷為疑似瘧疾感染，並且接受奎寧注射治療，這位病人每日回醫院就診觀察，一週後卻惡化為無法控制的嘔吐，帶血腹瀉、頭痛、暈眩伴隨呼吸困難，並開始自口、鼻、直腸等多處開始出血，於9月18日過世，病程僅約2周。
不久之後，更多病患帶著相似的症狀就醫，包括髮燒、頭痛、肌肉痛、關節痛、疲倦、噁心、暈眩等。這些常發展成帶血腹瀉、嚴重嘔吐和多發性出血，初期傳染可能肇因於重複使用用過卻未消毒之針筒，後續傳染主要則是照顧病患時，在沒有適當安全措施的情況下受到病毒侵襲或傳統埋葬前置作業的清洗過程。
2、蘇丹埃博拉病毒
蘇丹埃博拉病毒在1976年首次在蘇丹棉花廠工人身上被發現。研究人員指出，這名工人應該是在工廠中或附近接觸到到帶原生物宿主，但在檢測過工廠附近的動物及昆蟲後仍一無所獲，帶原宿主至今仍是未知。
第二個病例是一位住在蘇丹的夜店負責人，當地醫院用盡所有的方法治療他都沒有效果，最後還是宣告治。醫護人員在治療時並沒有適當的防護措施，導致病毒傳遍醫院發生大爆發。
最近的爆發發生於2004年5月。2004年5月，蘇丹Yambio縣回報20個病例，並有五人死亡。疾病管制局在幾天後確認這些病例為蘇丹埃博拉，鄰近國家例如烏干達、剛果皆增加邊界的守衛，以控制疫情。1976年蘇丹埃博拉的平均死亡率為53％，1979年為68％，2000年至2001年間為53％，平均死亡率為53.76％。
3、雷斯頓埃博拉病毒
1989年11月首次在一群由菲律賓進口至美國維珍尼亞州雷斯頓的食蟹猴身上發現。此一病毒對猴子有很高的致死率，但對人類並沒有致命性。
1990年2月，雷斯頓埃博拉病毒再次在雷斯頓、德州及菲律賓爆發。1992年及1996年，更多病例在意大利托斯卡納和德州發現。所有感染的猴只出現與猿猴出血熱類似的症狀。在這兩次爆發中，沒有任何人類受到感染。
4、科特迪瓦埃博拉病毒
科特迪瓦埃博拉病毒這個品種首先在科特迪瓦的塔伊國家公園中被發現。在1994年11月1日，二隻黑猩猩屍體在森林裡被發現。檢驗人員發現在心臟中的血液是棕色的且已液化（通常屍體中的血液在死亡十幾小時之後就應該完全凝固），內臟外觀並沒有明顯痕跡，肺中充滿血液。從黑猩猩身上採取到的組織顯示，此病毒與蘇丹埃博拉及1976年爆發的扎伊爾埃博拉十分相似。
1994年後，更多死亡的黑猩猩被發現，科學家用許多方法對病毒進行檢測。感染的來源被認為是一隻被黑猩猩捕食且帶有病毒的疣猴。
執行屍體檢驗的其中一位科學家感染了病毒。她出現了類似登革熱的症狀並在一星期後被送到瑞士治療。兩個星期後出院，在感染病毒之後的第六個星期完全康復。
