雙側眼瞼痙攣的治療目前仍然是醫學界的難題，根本原因是目前還不清楚雙側眼瞼痙攣發病的真正原因，也不明確該疾病的發病機制，目前大多學者認為是不明原因導致的中樞神經系統的功能紊亂。因此很多的治療都是對症治療，而不是對因治療，因此很難獲得治癒的效果。
目前的治療包括三種：
1、藥物治療
這也是眼瞼痙攣的首選治療方法，常用的藥物包括氯硝安定、氟哌啶醇、硫必利、苯海索等，部分病人在疾病的開始階段會有一定效果，但是隨著病程延長，療效會逐漸減退，或者是因為不能耐受藥物的副作用而停藥;
2、肉毒素治療
這是目前治療眼瞼痙攣較為有效的方法，通過在上下眼瞼內注射一定量的肉毒素而減弱痙攣的程度，肉毒素注射後效果明顯，但是療效持續的時間因人而異，多數在一到數月之間，失效後可以反覆注射。目前應用肉毒素治療最大的問題是部分人對肉毒素過敏、不能接受肉毒素帶來的副作用或者療效不明顯，因此肉毒素注射治療也應用有限;
3、外科治療
目前可以肯定的是雙側眼瞼痙攣患者中，來自面神經的下行神經衝動明顯亢進，這也是導致眼瞼痙攣的直接原因，因此針對面神經的外科手術試圖減弱明顯亢進的下行神經傳導，在部分病人中可以觀察到較好的效果，只不過並非所有的患者都能通過手術獲益，因此目前的外科治療只是作為藥物治療和肉毒素治療無效患者的補充治療方案，選擇需要慎重。
