1. 腎囊腫：典型的腎囊腫從影像檢查上很容易與腎癌相鑑別。但當囊腫內有出血或感染時，往往容易被誤診為腫瘤。對於囊壁不規則增厚、中心密度較高的良性腎囊腫，單獨應用上述任何一種檢查方法進行鑑別都比較困難，往往需要綜合分析、判斷，必要時可行穿刺活檢，輕易地放棄隨診或貿然地進行手術都是不可取的。
2.腎錯構瘤：又稱腎血管平滑肌脂肪瘤。是一種較為常見的腎臟良性腫瘤，在B超和CT圖像上都有特徵性表現，臨床上容易與腎癌進行鑑別。典型的錯構瘤內由於有脂肪成分的存在，B超示腫塊內有中強回聲區，CT示腫塊內有CT值為負值的區域，增強掃描後仍為負值。
3.腎臟淋巴瘤：腎臟淋巴瘤少見但並不罕見，腎臟淋巴瘤在影像學上缺乏特點，呈多髮結節狀或瀰漫性溼潤腎臟，使腎臟外形增大，腹膜後淋巴結多受累。
4.腎臟黃色肉芽腫：是一種少見的嚴重慢性腎實質感染的特殊類型,形態學上有兩種表現：一種為瀰漫型,腎臟體積增大、形態失常、內部結構紊亂，不容易與腫瘤混淆;另一種為局灶性，腎臟出現侷限性實質性結節狀回聲，缺乏特異性，有時與腫瘤難以鑑別。
5. 腎臟炎性假瘤：本病臨床表現主要為腰痛、低熱和血尿，腰部有時可捫及包塊，也可無任何症狀於體檢時發現，和腎癌的臨床表現極為相似。臨床上較為少見，有以下情況值得注意：腫塊邊界不整齊，包膜不完整，形態不規則;腫塊與相鄰的腎周圍有炎症圖像或腎周有血腫、積液等，提示有非惡性腫瘤的可能性。
6.腎癌與腎盂癌的鑑別診斷
a. 在CT上腎癌的典型表現為多血管病灶，增強時病灶強化的比腎盂癌更為明顯;
b. 腎盂癌通常位於腎中部，可向腎皮質內侵襲，而腎癌往往位於腎外周向內侵襲腎竇;
c. 腎盂癌腫瘤細胞學臨床診斷檢查有可能呈陽性，並有可能有輸尿管、膀胱病變，而腎癌通常腫瘤細胞學臨床診斷檢查呈陰性，病理變化侷限於腎部;
d. 腎盂癌早期即有肉眼血尿，而腎癌須腫瘤侵犯腎盂、腎盞以後才見血尿;
e. 腎癌臨床診斷檢查診斷重點依靠CT，而腎盂癌臨床診斷檢查診斷重點依靠排洩性或逆行泌尿系造影，也可行CTUCT尿路重建檢查。
