1.不孕症。一些患者會因為畸形精子症而不孕。如果畸形精子的比例高於50%，就成為高畸形率精子，這可能導致男性不育。
2.精子頭部：頭部長3.5-5.0微米，寬2.0-3.0微米；呈規則橢圓形。大頭是指頭部長和寬分別大於5和3微米，小於3和2微米的，稱為小頭、圓錐形、不規則、雙頭和 "梨形"。
3、精子中段畸形：中段長5.0-7.0微米，寬1.0微米。4.精子中段畸形：中段長5.0-7.0微米，寬1.0微米。如果細胞質液滴大於精子頭部的一半，說明精子不成熟，不正常，如果小於或等於頭部的一半，應該是正常的。中段斷裂也是不正常的。
4.精子尾部異常：尾部有45微米長。尾巴異常的意義尚不清楚，常見的是斷裂、兩段式或捲曲（不包括彎曲或不對稱的附著）。捲曲可能與鋅含量有關。其他缺陷可能與無症狀的生殖感染有關，因此如果出現這種表現，應進行細菌學檢查。
