西醫對小兒厭食症的治療主要以消化酶類、維生素類、微量元素的補充來滿足機體對能量物質的需求。
目前，比較一致地認為微量元素的缺乏可引起厭食症，故多采用鋅劑治療含鋅量低的厭食症，而對含鋅量正常的厭食症患兒暫無特異性治療。
況且鋅劑只能改善症狀，不能解決根本問題，長期使用鋅劑會出現一些不良反應。
單純補鋅也會影響銅、鈣、鐵的吸收，造成機體內部各微量元素不平衡。
中醫治療本病的方法很多，有中藥辨證治療、專方專藥治療、針炙推拿治療、外治貼敷治療。
中醫辨證治療認為本病分四種證型：脾失健運型，胃陰不足型，脾胃氣虛型，脾虛肝旺型。
四種證型在症狀方面有所側重，要由有專業知識的中醫生辨證施治。運用中醫的治療手法，如針刺四縫穴，捏脊治療，穴位注射或敷貼穴位等，均能取得較好的療效。
