肛瘻多是肛旁腫膿腫切開引流或自行破潰後，經久不愈形成潰口與肛門直腸相同的管道。因為經常從潰口處漏出膿血等分泌物，所以過去又稱為“肛漏”。
因為肛瘻多是由肛旁的膿腫所致，所以在治療膿腫時就要考慮治療方法對以後形成肛瘻的影響。膿腫的治療原則是“有膿必排”，在少量膿液時就要引流出來，以免越聚越多越深，腫塊疼痛增加。由於肛門的獨特生理結構，肛旁膿腫想用治療身體其他部位膿腫的方法治療，如單純應用抗生素控制感染等往往適得其反，有可能使簡單的病灶擴大蔓延，以致後來形成複雜性肛瘻。而選擇微創引流通暢的方法往往可以減少膿腫形成肛瘻的機率或使較大的膿腫形成單純的肛瘻。
肛瘻形成後，要想正確的處理和治療肛瘻，術前檢查尤其重要。術前檢查重點在於明確肛瘻的形態，走形分佈。知道了瘻管在甚麼位置，與肛門括約肌甚麼關係，就可以選擇微創的方法儘量的把管道切除，同時儘量不要損傷肛門括約肌。一般可以通過直腸腔內超聲或肛周磁共振檢查可以明確肛瘻形態和走形。另外術前腸鏡檢查也很重要，主要是看一下腸道是否有克羅恩病等，如果肛瘻是克羅恩病的併發症，那麼這種肛瘻的治療方法與常規手術有很大差別，一般也難以治癒。
