由於重症肌無力的主要症狀是肌無力和疲勞，所以有關運動療法在其治療中的價值倍受爭議。有關評價運動療法與重症肌無力的研究很少，但參照其他一些神經肌肉病的研究結果，可以看出運動對運動神經元病、運動神經根病變、周圍神經病和神經肌肉接頭傳遞障礙疾病以及肌肉疾病有所裨益。
方法包括有氧活動、呼吸訓練、平衡訓練和柔韌性訓練等。Becker的研究小組發現有氧活動可以減輕重症肌無力患者的疲勞，其方式包括游泳、散步和慢跑等低強度有氧活動，病人可獲得較高的生活質量並主訴疲勞感改善。
Rassler的研究小組則評估了呼吸訓練在重症肌無力中的作用，病人被要求每週進行5次呼吸訓練，每次進行30分鐘的正常碳酸呼吸強化訓練，連續4-6周後發現病人的呼吸耐受性增加，體重下降以及呼吸肌無力症狀改善。有限的研究表明運動並非是重症肌無力的禁忌，在專業人士的指導下進行適當的運動可能有助於患者生活質量的改善和症狀的緩解。
對於重症肌無力患者的運動有如下建議和指導：
①避免在極端的氣候下活動和跑步;
②避免進行長久耐力性運動，比如跑步大於20公里以上;
③摸索適合自己的跑步、登山和上樓的運動強度;
④在充分睡眠後運動並避免應激;⑤在一天中狀態最好的時候運動。
