(一)咽鼓管功能不良：一般認為咽鼓管阻塞是本病的基本原因。引起咽鼓管阻塞或咽鼓管功能不良的常見原因為機械性阻塞，如腺樣體肥大、肥厚性鼻炎、鼻咽部腫瘤或淋巴組織增生、長期鼻咽部填塞等。此外，顎帆張肌功能不良，如顎裂，易患本病。
(二) 感染：本病常繼發於急性上呼吸道感染，故認為本病可能與細菌或病毒感染有關。晚近發現中耳積液中細菌培養陽性者約1/2～1/3，主要為流感嗜血桿菌和肺炎球菌，而分離出病毒為數不多，故認為本病可能是中耳的一種輕型的或低毒性的細菌感染。細菌的產物—內毒素在發病機理中可能具有一定的作用 (三)免疫反應：中耳為一獨立的免疫防禦系統，隨著小兒年齡的增長方逐漸發育成熟，這可能是小兒本病發病率較高的原因之一。由於中耳積液中細菌培養的陽性率較高，炎性介質—前列腺素的存在，並在積液中檢出細菌的特異性抗體和免疫複合物以及補體系統等，提示慢性分泌性中耳炎可能屬於一種由感染免疫介導的病理過程。
