1、宮內妊娠 在妊娠前3個月，個別孕婦仍按月有少量流血，如誤認為月經正常來潮而子宮又增大，往往錯診為肌瘤。應詳細追問以往月經史(包括量的多少)，有無生育史，年齡多大(年青的肌瘤機會更少);還應注意有無妊娠反應。如為妊娠，子宮增大符合月經減少的月份;肌瘤者子宮較硬。此外妊娠者外陰、陰道著紫藍色，子宮頸柔軟，乳房脹感，乳暈外可出現次暈。妊娠達4個月以後，可感胎動或聽到胎心音，用手探觸可感到子宮收縮。除病史、體徵外，還可做妊娠試驗或B超顯象檢查來鑑別。
2、卵巢腫瘤 卵巢囊腫不易與子宮肌瘤混淆，因為兩者硬度不同，前者為囊性而後者為實性，同時前者與子宮中間有分界，可與之分開，而子宮肌瘤則與子宮關係密切不能與之分開，移動宮頸則隨之活動。診斷遇到困難較多的是卵巢實性腫瘤與漿膜下子宮肌瘤，兩者均為實性腫物。如果肌瘤在子宮的一側，尤其帶蒂漿膜下肌瘤有時鑑別困難，須借B超檢查協助。卵巢惡性腫瘤也為實性腫塊，與子宮牢固粘在一起融成一個團塊時，雖屬子宮外在腫塊但與之不能分開，有時被誤診為子宮肌瘤。年齡是一個重要的線索，肌瘤多見於中年婦女，有月經不調，而卵巢癌多見於老年婦女。若患者為絕經後婦女首先要考慮為卵巢惡性腫瘤，結合其他卵巢惡性腫瘤的體徵如子宮直腸陷凹結節或腫塊、子宮固定不動等均有鑑別價值。診斷性刮宮瞭解宮腔大小，方位以及內膜有無病變有幫助。B超檢查若見到雙側卵巢即可排除卵巢腫瘤，從子宮肌瘤與卵巢惡性腫瘤B型超聲的聲像圖之不同亦可鑑別。闊韌帶內巨大子宮肌瘤觸之為實性腫物，居子宮的一側，有時被誤診為卵巢實性腫瘤。卵巢實性腫瘤若不是惡性一般活動度好，而闊韌帶子宮肌瘤則活動受限。少見的情況下，巨大子宮肌瘤囊性變可被誤為卵巢囊腫。陰道檢查：若為大肌瘤囊性變，摸不到宮體，而卵巢囊腫，除囊腫外可觸及子宮體。
3、子宮內膜異位症 子宮內膜異位症是婦科常見病，而其臨床表現也是多種多樣。子宮內膜異位症往往宮骶韌帶增粗或有結節，病史上有痛經，經期肛門墜痛，腹瀉等症狀有助於與子宮肌瘤鑑別，子宮肌瘤有月經過多或經期紊亂，但無痛經。
4、子宮腺肌病 子宮腺肌病也表現為子宮增大，月經過多，好發於中年婦女。與子宮肌瘤，從病史與陰道檢查所見頗有類似之處，重要的鑑別點是子宮腺肌病的臨床症狀特點突出是進行性加重的痛經，並伴有肛門下墜感;陰道檢查子宮呈一致性增大，一般為10～12周妊娠大小，很少大於12周妊娠大小，其質地堅硬，有時經前及經後子宮大小可有變化。經前、經期子宮略增大而於經後較前略小，可能與肌壁間病灶內經期積血有關。子宮肌瘤的子宮多呈不規則增大、質韌，雖有月經過多症狀但無痛經。有時兩者可以並存，子宮肌瘤合併子宮腺肌病，病史可以出現痛經症狀。
5、子宮內膜癌 子宮內膜癌常見症狀是不規則陰道出血，並有子宮增大，從臨床症狀與體徵均有相似之處。發病年齡不同，子宮內膜癌好發於老年婦女以絕經後出血為多見，同時有白帶增多而子宮肌瘤則多見於中年婦女。陰道檢查兩者均有子宮增大，子宮內膜癌子宮為一致性增大，質較軟。對更年期婦女應警惕子宮肌瘤合併子宮內膜癌。因此子宮肌瘤患者術前常規作診斷性刮宮可以排除子宮內膜癌。
6、子宮頸癌 宮頸癌症狀有不規則陰道出血，白帶增多或流惡臭的陰道溢液而子宮黏膜下肌瘤脫出於宮頸口或宮頸黏膜下肌瘤伴有感染均可產生同樣的症狀。窺器看陰道內腫物表面有潰爛、壞死，外觀似菜花狀宮頸癌。陰道檢查可協助鑑別。子宮頸癌宮頸增大、硬，腫物表面脆，極易出血，穹隆部往往也被累及變硬;而黏膜下肌瘤表面光滑、不硬、不脆，子宮頸質軟，穹隆完整質軟，帶蒂黏膜下肌瘤可以轉動。宮頸刮片及組織活檢可確診宮頸癌。
