1.與宮體黏膜下肌瘤的鑑別 宮頸黏膜下肌瘤須與宮體黏膜下肌瘤相鑑別，根據病史、症狀、檢查即可鑑別，宮頸黏膜下肌瘤表現為經量正常，診刮所得病理檢查見典型的子宮黏膜，診斷即可明確。
2.與宮體部肌瘤的鑑別 有時宮頸肌瘤較大佔據骨盆腔，將子宮體推向上方，難於鑑別是宮體抑或是宮頸肌瘤，必要時可做子宮輸卵管碘油造影，見頸管延長及宮腔位置較高，可與宮體肌瘤相鑑別。
3.與慢性子宮內翻的鑑別 從病史、症狀及體徵可鑑別，子宮內翻往往有產後出血史以及經量增多，檢查可見翻出的子宮突出於宮頸口外，被擴張的均勻一圈宮頸邊緣圍繞，有時突出的子宮黏膜面上可見輸卵管開口。
4.與宮頸癌鑑別 宮頸黏膜下肌瘤有血性或膿性白帶增多，繼發感染時，有惡臭排液常誤診為宮頸癌。宮頸癌癌瘤不規則，表面菜花狀或有潰瘍，基底部有浸潤，輪廓不清，且組織脆易出血。活組織檢查確診。
5.與卵巢腫瘤鑑別 向側壁生長的宮頸肌瘤最終形成闊韌帶肌瘤，無月經改變，又在子宮一側捫及實質性腫塊，臨床上易誤診為卵巢腫瘤。應仔細行婦科檢查，注意腫塊與子宮關係及其活動度，結合B型超聲檢查，必要時做宮腔探查術，探查宮腔長度及方向，一般均可準確診斷。
6.與宮頸息肉鑑別 宮頸息肉有性交後出血或經量增多，須與宮頸肌瘤鑑別，息肉色鮮紅，呈舌狀，質軟，而宮頸黏膜下肌瘤有蒂伸入宮頸管，呈球形，質硬。
7.與宮頸妊娠鑑別 宮頸妊娠有不規則陰道流血，流血量由少到多，嚴重時可發生休克甚至危及生命。B超檢查提示胚胎完全種植在宮頸管內即可鑑別。
