病毒感染、藥物可致自然流產
胚胎著床後31%發生自然流產，其中80%為早期流產，即在妊娠期12周之前流產。懷孕早期流產中胚胎或胎兒畸形是最常見的原因，約佔50%~60%，而中期妊娠流產中約佔1/3，晚期妊娠胎兒丟失佔5%。胚胎或胎兒畸形也會引起自然流產，造成胚胎或胎兒畸形除遺傳因素外，可能的原因有病毒感染、藥物等因素。
病毒感染可能引起胚胎或胎兒畸形，也會導致孕婦自然流產。這類病毒包括風疹病毒、弓形蟲、鉅細胞病毒等。弓形蟲可能存在於貓狗等寵物體內，孕婦不要接觸。
為此醫生提醒，在懷孕初期儘量少到公共場所去，尤其是在風疹病毒等流行的季節交替時。另外，孕婦儘量少吃燒烤、麻辣燙等食物，尤其不要吃路邊攤，以免這些食物因未煮熟或者質量有問題導致病毒感染。
精神壓力大、多喝咖啡增加流產幾率
長期精神過度緊張、焦慮、恐懼等不良情緒也會誘發流產的發生。家庭、工作等多方面的壓力或者懷孕後過分擔心孩子保不住造成的精神焦慮、緊張，也會導致流產。因精神緊張誘發流產的孕婦有增多的趨勢。強烈應激刺激與不良生活習慣也會增加自然流產的風險，強烈應激刺激包括手術、直接撞擊腹部、性交過頻等。孕婦過量吸菸、酗酒、過量飲咖啡、熬夜、吸毒等，這些習慣都能夠增加流產的風險。
免疫功能異常
孕婦存在免疫功能異常能夠導致自然流產，甚至反覆流產。如果出現反覆流產，並且查無其他原因的，就要警惕是否是因為免疫功能異常導致的，可以在醫生指導下進行治療。
高齡產婦
現在很多人推崇“晚婚晚育”，選擇在三十歲後要孩子，但孕婦年齡越大自然流產的風險也相應增加。目前把大於35週歲的孕婦被定義為高齡產婦。高齡產婦嬰兒畸形的發生率很高。一般新生兒患先天愚型的幾率為1/800，但如果孕婦年齡大於45歲，嬰兒患先天性愚型的幾率提到1/25。建議最好在35歲以前懷孕生產。
