对中枢神经系统的作用
石菖蒲有镇静作用。煎剂或挥发油均能使小鼠自发活动减少， 石菖蒲解除单笼饲养小鼠的攻击行为;亦能延长戊巴比妥钠所致的睡眠时间，对阈下催眠剂量的戊巴比妥钠有协同作用。此外， 尚能显著延长戊巴比妥钠的麻醉时间。研究表明：挥发油中的细辛醚是镇静的有效成分，但除去挥发油后仍有镇静作用， 提示其镇静成分不只一种。
石菖蒲煎剂对戊四氮引起的小鼠惊厥有一定的对抗作用，与对照组相比， 能使自主活动减少，抽搐开始时间推迟， 抽搐鼠数较少。挥发油中的α-细辛醚140mg/kg能完全对抗小鼠电惊厥和戊四氮惊厥，并能对抗家兔侧脑室给Ach所致惊厥，除去挥发油的水煎剂亦有作用。
石菖蒲挥发油对小鼠有较强的降温作用。石菖蒲根茎水提取物制成的片剂， 在临床上用于治疗癫痫病及其他神经系统疾患，有较好疗效， 其挥发油对某些神经系统的动物模型具有显著的生理活性。
对心血管系统的作用石菖蒲挥发油(β-细辛醚)在一定浓度下有使豚鼠冠状血管扩张的作用。临床常用于冠心病、肺心病等属于痰浊气滞之胸痹者的治疗，其机制可能与其能增加冠脉流量有关， 还可能与镇静、改善消化机能、平喘、镇咳等作用有关。
对消化系统的作用石菖蒲煎剂内服能促进消化液的分泌及制止胃肠异常发酵，并有缓解肠管平滑肌痉挛的作用。石菖蒲中含的细辛醚能对抗氯化钡引起的离体肠管的兴奋作用。
抗真菌作用菖蒲水浸剂(1：3)， 在试管内对堇色毛癣菌、同心性毛癣菌、许兰黄癣菌、奥杜盎小芽胞癣菌、铁锈色小芽胞癣菌、羊毛状小芽胞癣菌、腹股沟表批癣菌、红色表皮癣菌、考夫曼-沃尔夫表皮癣菌、星形奴卡菌等皮肤真菌均有不同程度的抑制作用。
其他作用石菖蒲中所含的α-细辛醚有平喘作用，能对抗组胺引起的支气管收缩， 并有镇咳作用。临床上对支气管哮喘患者的肺通气功能有改善作用。
