尽管瘘管和肛窦道都是感染破裂后形成的管道，但它们并不是一回事。窦道是一种从身体表面通向深层组织的病症；它只有身体表面的外部开口，而不像肛瘘那样也有身体内部的开口，两者的处理方式也不同。
窦道的形成原因有：细菌通过皮肤引起的深层组织感染；外伤，如某些物体刺穿身体；以及淋巴结核引起的感染。
肛瘘是肛门直肠周围脓肿的后遗症病变，其根本原因是肛门腺的感染。为什么肛周脓肿不能自行愈合，破溃后形成肛瘘？
一般认为有以下原因：
1.肛周脓肿的破口或切口多在肛门外，脓液从外口流出，但原发感染藏在肛窦内。肛窦是继发感染的门户，因为肛窦向上开口，在直肠腔内开放，细菌和肠内容物都可以通过肛窦进入脓腔，引起反复感染，形成瘘管。
2.瘘道经过肛门括约肌之间，由于括约肌经常收缩、舒张，影响了脓液的排出，容易感染蓄脓，难以愈合。
3、脓肿破溃后，脓液排出，脓腔逐渐缩小，腔壁形成剪影状管壁，结缔组织增生，不能愈合。
4.瘘管弯曲，或分支，引流不畅，反复感染，导致瘘管不能愈合。
