目前对儿童睡眠障碍的发病机理尚未清楚，其中：
一、身体因素：
1、儿童患扁桃体炎的次数：小儿多次患扁桃体炎，会造成扁桃体的慢性增生和肥大，部分堵塞呼吸道，睡眠时口咽部肌肉松弛，又进一步加重了呼吸道阻塞，二者共同作用使呼吸时气流不畅;
2、夜间喘息发作的次数，小儿夜间多次喘息发作，常提示有喘息性疾病的存在;
3、研究结果提示一种与大脑皮层发育延迟有关的发育性疾病,由于大脑发育延迟而扰乱了正常的睡眠节律,因而出现夜枰梦多睡惊等症状.虽然对大脑发育延迟无根本解决方法,但对引起它发病的危险因素如心理因抚育不当等,则值得注意.
二、外界因素 影响儿童睡眠障碍的独立危险因素包括：
1、父母有睡眠障碍史(如打鼾、梦呓、夜间磨牙)。
2、根据调查,处在不良的家庭环境中,如父母经常争吵、闹矛盾或离异家庭中，儿童睡眠障碍发生率偏高;家庭教养方式不当，如父母教育子女简单粗暴，严厉约束;父母之间教育方式不一致其中一方过分袒护等都会使孩子精神焦虑、内心矛盾、无所适从，最终心理失衡，成为儿童睡眠障碍的主要危险因素。
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