1.手术治疗的原则清除所有炎症和坏死组织。根据不同的部位，用适当的方法确切闭合穿孔;矫正并除去食管穿孔远侧梗阻。当损伤发生在食管梗阻的近段或在梗阻的部位，或当诊断过晚(一般>24小时)，直接修补损伤的食管则是禁忌的。
2.手术方案
(1)颈部穿孔 小的颈部食管穿孔，处理上往往仅需要在穿孔的旁边放一引流，瘘口即可自己闭合，而不必做进一步手术处理。
(2)胸部穿孔 食管中上段穿孔时可经4、5肋间进胸腔，下段穿孔则经6、7肋间进胸腔，如没有胸腔污染，中上段从右侧开胸，下段从左侧开胸，根据食管破入哪一侧胸腔时，则应从哪一侧开胸，以便于手术处理。
(3)腹部穿孔 腹部穿孔如果胸腔没有污染，手术控查可直接经上腹部正中切口进行。不论穿孔在什么部位，显露食管后，可通过食管内的导管向食管腔内注入亚甲蓝或注入气体来确定穿孔的部位。
3.手术方法
(1)引流 有效的引流是必不可少的，特别在广泛炎症和全身情况不佳时，必要时应在CT引导下置入引流管。这种方法在颈部穿孔和胸部穿孔患者都有效。
(2)一期缝合 在早期诊断的患者，当有手术适应证时，应行急诊手术，缝合修补穿孔的食管。一期闭合最好是在健康的食管组织，当有远端梗阻时，单纯一期闭合是无效的，必须同时解决梗阻。
(3)加固缝合 由于一期缝合食管损伤有裂开和瘘的可能性，特别是当患者从穿孔到治疗时已隔了几个小时，因此有必要采用加固缝合的方法闭合食管穿孔。
(4)同时处理食管疾病 在患者的情况能够接受手术、病变的食管又可以切除的情况下，最好的处理办法是手术切除病变的食管。食管切除后，采用一期还是二期消化道再建，需根据污染的情况和患者的情况决定。
(5)食管外置 食管外置或旷置的手术近年来已很少使用，只有在患者的营养状况极度不良时，用前述种种方法均不适合或无效的病例，才用颈部食管外置造瘘术或胃造瘘减压术。
