1、内口位置不正确
内口是肛瘘的感染源，肠腔内的致病菌正是从内口进入肛周，引起肛周脓肿和肛瘘，一般位于肛门内3～4cm的直肠与肛管交界处。外口是感染病灶的溃疡口，大多在肛缘外，但也有少数病例在肛门内。肛瘘手术成败的最重要因素是对内口的准确定位和对内口的充分切开。
2.挂线技术盲目人工造内口
挂线技术是一种中医治疗方法，是目前临床治疗肛瘘最重要的方法，其原理是利用粘线的弹性收缩，慢性切断管壁，打开瘘管进行治疗。其主要原因是：不仅痛苦大，愈合时间长，对肛门括约肌损伤重，而且复发率高。
3、主病灶不开放
什么是主病灶？主病灶，根据瘘管不同部位对治疗的重要性，我们把瘘管分为主病灶和分支。主要病灶是指来自内口和与内口相连的肛管段的瘘管，还有伴随着肛门内外括约肌的瘘管。在治疗中，必须对主要病灶进行切开。外口和与之相连的瘘管被称为分支，只要它们被引流，就不需要打开。其结果是，伤口永远不会愈合，或暂时愈合，然后塌陷复发。
4、漏支
肛瘘手术打开主灶很重要，分支引流同样重要，如果在手术中漏支而没有处理，也会造成手术的失败，这种情况发生在复杂的肛瘘和病程长的复发性肛瘘。复杂性肛瘘的分支多，瘘管弯曲，复发性肛瘘的瘢痕较重，很难找到分支，手术中容易遗漏，形成残留的窦道，术后会反复感染。
5.术后假性愈合
术后换药是肛瘘手术治疗的一个重要环节。肛瘘的治疗是一个漫长的过程，在这个过程中，我们需要不断地学习，不断地总结，不断地总结，不断地总结，不断地总结，不断地总结，不断地总结，不断地总结。这就是为什么不仅要用油沙条填塞瘘管腔，而且要用油沙分离断端两侧的肛管皮肤。
