1.大多数十二指肠溃疡穿孔患者有溃疡病史，其腹痛剧烈，连续的刀割样疼痛，有时引起患者休克，腹壁明显强直，常为 "板状"，压痛，反跳痛；肠鸣音消失；腹部X线检查可发现膈肌下有游离气体。其中第一种是小穿孔，第二种是慢性穿孔，这可能难以诊断。
2.急性胰腺炎腹痛多位于上腹或左侧，体征不如急性胆囊炎明显，Murphy征阴性；血清淀粉酶明显升高；B超显示胰腺肿大，边界不清，无急性胆囊炎体征；CT检查比B超诊断急性胰腺炎更可靠，因为B超常因腹胀而无法显示胰腺。
3.高位急性阑尾炎为转移性腹痛，腹壁压痛，腹肌强直可局限于右上腹，易误诊为急性胆囊炎，但超声检查无急性胆囊炎体征，罗氏征（Rovsing）阳性（按压左下腹可引起阑尾疼痛）有助于鉴别。
胆囊炎反复发作的病史和疼痛的特点对鉴别诊断也有参考价值。
4.急性肠梗阻的绞痛多位于下腹部，常伴有肠鸣音亢进、"金属音 "或气过水音，腹痛无放射，腹肌不紧张，X线检查可见腹腔内有液体平面
5.右肾结石发热少见，患者多伴有腰痛，向会阴部放射 患者有肾区叩击痛，肉眼血尿或镜下血尿，X线腹部平片结石阳性，B超检查有肾结石或伴肾盂扩张。
6.右侧大叶性肺炎和胸膜炎患者也可有右上腹痛、压痛和肌肉守护，与急性胆囊炎相混淆，但早期往往有高热、咳嗽、胸痛等。胸部检查时呼吸困难，可听到啰音或胸膜摩擦音。
7.冠心病的心绞痛常有上腹中部或右上腹的疼痛，如果被误诊为急性胆囊炎而进行麻醉或手术，有时可导致立即死亡。
8.急性病毒性肝炎伴有急性重度黄疸，可有类似胆囊炎的右上腹痛和肌肉守护，发热，白细胞计数增高和黄疸，但肝炎患者常有食欲不振、乏力、低热等前驱症状；体检常发现肝区广泛压痛，白细胞一般不增高，肝功能明显异常，一般不难区分。
